Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSD3Q9NYI0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSD3Q9NYI0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSD3Q9NYI0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSD3Q9NYI0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSD3Q9NYI0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSD3Q9NYI0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSD3Q9NYI0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSD3Q9NYI0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSD3Q9NYI0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSD3Q9NYI0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSD3Q9NYI0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PSD3Q9NYI0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSD3Q9NYI0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSD3Q9NYI0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSD3Q9NYI0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSD3Q9NYI0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSD3Q9NYI0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSD3Q9NYI0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSD3Q9NYI0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSD3Q9NYI0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSD3Q9NYI0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSD3Q9NYI0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSD3Q9NYI0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PSD3Q9NYI0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSD3Q9NYI0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSD3Q9NYI0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSD3Q9NYI0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSD3Q9NYI0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSD3Q9NYI0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSD3Q9NYI0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSD3Q9NYI0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSD3Q9NYI0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSD3Q9NYI0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSD3Q9NYI0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSD3Q9NYI0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSD3Q9NYI0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSD3Q9NYI0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSD3Q9NYI0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSD3Q9NYI0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSD3Q9NYI0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSD3Q9NYI0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSD3Q9NYI0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSD3Q9NYI0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSD3Q9NYI0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSD3Q9NYI0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSD3Q9NYI0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSD3Q9NYI0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSD3Q9NYI0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSD3Q9NYI0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PSD3Q9NYI0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PSD3Q9NYI0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PSD3Q9NYI0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSD3Q9NYI0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSD3Q9NYI0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSD3Q9NYI0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSD3Q9NYI0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PSD3Q9NYI0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSD3Q9NYI0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSD3Q9NYI0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSD3Q9NYI0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSD3Q9NYI0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSD3Q9NYI0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSD3Q9NYI0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSD3Q9NYI0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSD3Q9NYI0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSD3Q9NYI0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSD3Q9NYI0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSD3Q9NYI0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSD3Q9NYI0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSD3Q9NYI0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSD3Q9NYI0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSD3Q9NYI0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSD3Q9NYI0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSD3Q9NYI0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSD3Q9NYI0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSD3Q9NYI0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSD3Q9NYI0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSD3Q9NYI0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSD3Q9NYI0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSD3Q9NYI0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSD3Q9NYI0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSD3Q9NYI0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSD3Q9NYI0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSD3Q9NYI0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSD3Q9NYI0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSD3Q9NYI0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSD3Q9NYI0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSD3Q9NYI0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSD3Q9NYI0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSD3Q9NYI0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PSD3Q9NYI0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSD3Q9NYI0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSD3Q9NYI0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSD3Q9NYI0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSD3Q9NYI0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSD3Q9NYI0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSD3Q9NYI0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSD3Q9NYI0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSD3Q9NYI0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.8 ms