Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM53CQ9NYF3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM53CQ9NYF3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM53CQ9NYF3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM53CQ9NYF3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM53CQ9NYF3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM53CQ9NYF3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM53CQ9NYF3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM53CQ9NYF3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM53CQ9NYF3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM53CQ9NYF3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FAM53CQ9NYF3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FAM53CQ9NYF3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FAM53CQ9NYF3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
FAM53CQ9NYF3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
FAM53CQ9NYF3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FAM53CQ9NYF3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM53CQ9NYF3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM53CQ9NYF3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM53CQ9NYF3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM53CQ9NYF3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM53CQ9NYF3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FAM53CQ9NYF3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FAM53CQ9NYF3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM53CQ9NYF3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM53CQ9NYF3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM53CQ9NYF3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM53CQ9NYF3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM53CQ9NYF3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM53CQ9NYF3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM53CQ9NYF3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM53CQ9NYF3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM53CQ9NYF3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM53CQ9NYF3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM53CQ9NYF3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM53CQ9NYF3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM53CQ9NYF3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM53CQ9NYF3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM53CQ9NYF3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM53CQ9NYF3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM53CQ9NYF3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM53CQ9NYF3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM53CQ9NYF3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM53CQ9NYF3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM53CQ9NYF3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM53CQ9NYF3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM53CQ9NYF3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM53CQ9NYF3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM53CQ9NYF3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM53CQ9NYF3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM53CQ9NYF3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM53CQ9NYF3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM53CQ9NYF3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM53CQ9NYF3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM53CQ9NYF3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM53CQ9NYF3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM53CQ9NYF3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM53CQ9NYF3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM53CQ9NYF3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM53CQ9NYF3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM53CQ9NYF3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM53CQ9NYF3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM53CQ9NYF3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM53CQ9NYF3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM53CQ9NYF3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM53CQ9NYF3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM53CQ9NYF3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM53CQ9NYF3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM53CQ9NYF3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM53CQ9NYF3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM53CQ9NYF3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM53CQ9NYF3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM53CQ9NYF3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM53CQ9NYF3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM53CQ9NYF3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM53CQ9NYF3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM53CQ9NYF3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM53CQ9NYF3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM53CQ9NYF3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM53CQ9NYF3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM53CQ9NYF3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM53CQ9NYF3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM53CQ9NYF3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM53CQ9NYF3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM53CQ9NYF3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM53CQ9NYF3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM53CQ9NYF3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM53CQ9NYF3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM53CQ9NYF3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM53CQ9NYF3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM53CQ9NYF3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
FAM53CQ9NYF3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM53CQ9NYF3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM53CQ9NYF3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM53CQ9NYF3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM53CQ9NYF3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM53CQ9NYF3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM53CQ9NYF3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM53CQ9NYF3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM53CQ9NYF3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.5 ms