Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA4

MTMR4, Myotubularin-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4Q9NYA4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MTMR4Q9NYA4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MTMR4Q9NYA4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MTMR4Q9NYA4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
MTMR4Q9NYA4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MTMR4Q9NYA4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MTMR4Q9NYA4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MTMR4Q9NYA4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MTMR4Q9NYA4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MTMR4Q9NYA4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MTMR4Q9NYA4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MTMR4Q9NYA4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MTMR4Q9NYA4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MTMR4Q9NYA4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MTMR4Q9NYA4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MTMR4Q9NYA4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MTMR4Q9NYA4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MTMR4Q9NYA4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MTMR4Q9NYA4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MTMR4Q9NYA4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MTMR4Q9NYA4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MTMR4Q9NYA4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MTMR4Q9NYA4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MTMR4Q9NYA4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MTMR4Q9NYA4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MTMR4Q9NYA4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MTMR4Q9NYA4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MTMR4Q9NYA4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MTMR4Q9NYA4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MTMR4Q9NYA4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MTMR4Q9NYA4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MTMR4Q9NYA4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MTMR4Q9NYA4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
MTMR4Q9NYA4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
MTMR4Q9NYA4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MTMR4Q9NYA4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MTMR4Q9NYA4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MTMR4Q9NYA4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29■■■□□ 2.23
MTMR4Q9NYA4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29■■■□□ 2.23
MTMR4Q9NYA4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
MTMR4Q9NYA4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MTMR4Q9NYA4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MTMR4Q9NYA4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
MTMR4Q9NYA4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MTMR4Q9NYA4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MTMR4Q9NYA4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MTMR4Q9NYA4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MTMR4Q9NYA4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MTMR4Q9NYA4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
MTMR4Q9NYA4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MTMR4Q9NYA4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MTMR4Q9NYA4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MTMR4Q9NYA4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MTMR4Q9NYA4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MTMR4Q9NYA4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MTMR4Q9NYA4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MTMR4Q9NYA4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
MTMR4Q9NYA4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
MTMR4Q9NYA4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MTMR4Q9NYA4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
MTMR4Q9NYA4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
MTMR4Q9NYA4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MTMR4Q9NYA4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MTMR4Q9NYA4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MTMR4Q9NYA4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
MTMR4Q9NYA4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MTMR4Q9NYA4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MTMR4Q9NYA4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MTMR4Q9NYA4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MTMR4Q9NYA4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MTMR4Q9NYA4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MTMR4Q9NYA4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MTMR4Q9NYA4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MTMR4Q9NYA4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MTMR4Q9NYA4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MTMR4Q9NYA4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MTMR4Q9NYA4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
MTMR4Q9NYA4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MTMR4Q9NYA4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
MTMR4Q9NYA4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MTMR4Q9NYA4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MTMR4Q9NYA4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
MTMR4Q9NYA4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MTMR4Q9NYA4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
MTMR4Q9NYA4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
MTMR4Q9NYA4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MTMR4Q9NYA4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MTMR4Q9NYA4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MTMR4Q9NYA4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MTMR4Q9NYA4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MTMR4Q9NYA4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MTMR4Q9NYA4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MTMR4Q9NYA4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MTMR4Q9NYA4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MTMR4Q9NYA4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MTMR4Q9NYA4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MTMR4Q9NYA4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
MTMR4Q9NYA4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MTMR4Q9NYA4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
MTMR4Q9NYA4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms