Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNA2D2Q9NY47 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNA2D2Q9NY47 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNA2D2Q9NY47 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNA2D2Q9NY47 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNA2D2Q9NY47 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNA2D2Q9NY47 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNA2D2Q9NY47 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNA2D2Q9NY47 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNA2D2Q9NY47 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNA2D2Q9NY47 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNA2D2Q9NY47 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNA2D2Q9NY47 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNA2D2Q9NY47 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA2D2Q9NY47 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA2D2Q9NY47 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA2D2Q9NY47 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA2D2Q9NY47 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA2D2Q9NY47 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA2D2Q9NY47 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNA2D2Q9NY47 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNA2D2Q9NY47 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNA2D2Q9NY47 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNA2D2Q9NY47 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNA2D2Q9NY47 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNA2D2Q9NY47 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNA2D2Q9NY47 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNA2D2Q9NY47 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNA2D2Q9NY47 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNA2D2Q9NY47 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNA2D2Q9NY47 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNA2D2Q9NY47 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNA2D2Q9NY47 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNA2D2Q9NY47 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNA2D2Q9NY47 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNA2D2Q9NY47 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNA2D2Q9NY47 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNA2D2Q9NY47 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNA2D2Q9NY47 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNA2D2Q9NY47 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNA2D2Q9NY47 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNA2D2Q9NY47 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNA2D2Q9NY47 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNA2D2Q9NY47 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNA2D2Q9NY47 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNA2D2Q9NY47 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNA2D2Q9NY47 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNA2D2Q9NY47 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNA2D2Q9NY47 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNA2D2Q9NY47 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNA2D2Q9NY47 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNA2D2Q9NY47 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNA2D2Q9NY47 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNA2D2Q9NY47 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA2D2Q9NY47 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA2D2Q9NY47 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA2D2Q9NY47 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA2D2Q9NY47 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA2D2Q9NY47 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA2D2Q9NY47 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNA2D2Q9NY47 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNA2D2Q9NY47 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNA2D2Q9NY47 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNA2D2Q9NY47 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNA2D2Q9NY47 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNA2D2Q9NY47 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA2D2Q9NY47 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA2D2Q9NY47 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA2D2Q9NY47 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA2D2Q9NY47 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNA2D2Q9NY47 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNA2D2Q9NY47 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNA2D2Q9NY47 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNA2D2Q9NY47 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNA2D2Q9NY47 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNA2D2Q9NY47 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNA2D2Q9NY47 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNA2D2Q9NY47 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNA2D2Q9NY47 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNA2D2Q9NY47 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNA2D2Q9NY47 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNA2D2Q9NY47 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNA2D2Q9NY47 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNA2D2Q9NY47 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNA2D2Q9NY47 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNA2D2Q9NY47 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA2D2Q9NY47 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA2D2Q9NY47 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA2D2Q9NY47 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA2D2Q9NY47 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA2D2Q9NY47 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA2D2Q9NY47 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNA2D2Q9NY47 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNA2D2Q9NY47 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNA2D2Q9NY47 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNA2D2Q9NY47 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNA2D2Q9NY47 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNA2D2Q9NY47 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNA2D2Q9NY47 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNA2D2Q9NY47 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms