Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM248Q9NWD8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM248Q9NWD8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM248Q9NWD8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM248Q9NWD8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM248Q9NWD8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM248Q9NWD8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMEM248Q9NWD8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM248Q9NWD8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM248Q9NWD8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM248Q9NWD8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM248Q9NWD8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM248Q9NWD8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM248Q9NWD8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM248Q9NWD8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM248Q9NWD8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM248Q9NWD8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM248Q9NWD8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM248Q9NWD8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM248Q9NWD8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM248Q9NWD8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM248Q9NWD8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM248Q9NWD8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM248Q9NWD8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM248Q9NWD8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM248Q9NWD8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM248Q9NWD8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM248Q9NWD8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM248Q9NWD8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM248Q9NWD8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM248Q9NWD8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM248Q9NWD8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM248Q9NWD8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM248Q9NWD8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM248Q9NWD8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM248Q9NWD8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM248Q9NWD8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM248Q9NWD8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM248Q9NWD8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMEM248Q9NWD8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMEM248Q9NWD8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM248Q9NWD8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM248Q9NWD8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM248Q9NWD8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM248Q9NWD8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM248Q9NWD8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM248Q9NWD8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM248Q9NWD8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM248Q9NWD8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM248Q9NWD8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM248Q9NWD8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM248Q9NWD8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM248Q9NWD8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM248Q9NWD8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM248Q9NWD8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM248Q9NWD8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM248Q9NWD8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM248Q9NWD8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM248Q9NWD8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM248Q9NWD8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM248Q9NWD8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM248Q9NWD8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM248Q9NWD8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM248Q9NWD8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM248Q9NWD8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM248Q9NWD8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM248Q9NWD8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
TMEM248Q9NWD8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM248Q9NWD8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM248Q9NWD8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM248Q9NWD8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM248Q9NWD8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM248Q9NWD8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM248Q9NWD8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM248Q9NWD8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM248Q9NWD8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM248Q9NWD8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM248Q9NWD8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM248Q9NWD8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM248Q9NWD8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM248Q9NWD8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM248Q9NWD8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM248Q9NWD8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM248Q9NWD8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM248Q9NWD8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM248Q9NWD8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM248Q9NWD8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM248Q9NWD8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM248Q9NWD8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM248Q9NWD8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM248Q9NWD8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM248Q9NWD8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM248Q9NWD8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM248Q9NWD8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM248Q9NWD8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM248Q9NWD8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM248Q9NWD8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM248Q9NWD8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM248Q9NWD8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM248Q9NWD8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms