Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG7

SDR39U1, Epimerase family protein SDR39U1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR39U1Q9NRG7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDR39U1Q9NRG7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDR39U1Q9NRG7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SDR39U1Q9NRG7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDR39U1Q9NRG7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDR39U1Q9NRG7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDR39U1Q9NRG7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDR39U1Q9NRG7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDR39U1Q9NRG7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDR39U1Q9NRG7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDR39U1Q9NRG7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDR39U1Q9NRG7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDR39U1Q9NRG7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDR39U1Q9NRG7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SDR39U1Q9NRG7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SDR39U1Q9NRG7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SDR39U1Q9NRG7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SDR39U1Q9NRG7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDR39U1Q9NRG7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDR39U1Q9NRG7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDR39U1Q9NRG7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDR39U1Q9NRG7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDR39U1Q9NRG7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDR39U1Q9NRG7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDR39U1Q9NRG7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDR39U1Q9NRG7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDR39U1Q9NRG7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDR39U1Q9NRG7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDR39U1Q9NRG7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDR39U1Q9NRG7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDR39U1Q9NRG7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDR39U1Q9NRG7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDR39U1Q9NRG7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDR39U1Q9NRG7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDR39U1Q9NRG7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDR39U1Q9NRG7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDR39U1Q9NRG7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDR39U1Q9NRG7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDR39U1Q9NRG7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDR39U1Q9NRG7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDR39U1Q9NRG7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDR39U1Q9NRG7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDR39U1Q9NRG7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDR39U1Q9NRG7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDR39U1Q9NRG7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDR39U1Q9NRG7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDR39U1Q9NRG7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDR39U1Q9NRG7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDR39U1Q9NRG7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDR39U1Q9NRG7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDR39U1Q9NRG7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDR39U1Q9NRG7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDR39U1Q9NRG7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDR39U1Q9NRG7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDR39U1Q9NRG7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDR39U1Q9NRG7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDR39U1Q9NRG7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDR39U1Q9NRG7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDR39U1Q9NRG7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDR39U1Q9NRG7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDR39U1Q9NRG7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDR39U1Q9NRG7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDR39U1Q9NRG7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDR39U1Q9NRG7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SDR39U1Q9NRG7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SDR39U1Q9NRG7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDR39U1Q9NRG7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SDR39U1Q9NRG7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDR39U1Q9NRG7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDR39U1Q9NRG7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDR39U1Q9NRG7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDR39U1Q9NRG7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDR39U1Q9NRG7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDR39U1Q9NRG7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDR39U1Q9NRG7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDR39U1Q9NRG7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SDR39U1Q9NRG7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDR39U1Q9NRG7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDR39U1Q9NRG7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDR39U1Q9NRG7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDR39U1Q9NRG7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDR39U1Q9NRG7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDR39U1Q9NRG7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDR39U1Q9NRG7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDR39U1Q9NRG7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDR39U1Q9NRG7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDR39U1Q9NRG7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDR39U1Q9NRG7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SDR39U1Q9NRG7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDR39U1Q9NRG7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDR39U1Q9NRG7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDR39U1Q9NRG7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDR39U1Q9NRG7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDR39U1Q9NRG7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDR39U1Q9NRG7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDR39U1Q9NRG7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDR39U1Q9NRG7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDR39U1Q9NRG7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SDR39U1Q9NRG7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDR39U1Q9NRG7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms