Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG5

RPRD1B, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1BQ9NQG5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPRD1BQ9NQG5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPRD1BQ9NQG5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPRD1BQ9NQG5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPRD1BQ9NQG5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPRD1BQ9NQG5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPRD1BQ9NQG5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPRD1BQ9NQG5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPRD1BQ9NQG5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RPRD1BQ9NQG5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPRD1BQ9NQG5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPRD1BQ9NQG5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPRD1BQ9NQG5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPRD1BQ9NQG5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPRD1BQ9NQG5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPRD1BQ9NQG5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RPRD1BQ9NQG5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPRD1BQ9NQG5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPRD1BQ9NQG5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPRD1BQ9NQG5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPRD1BQ9NQG5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPRD1BQ9NQG5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPRD1BQ9NQG5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPRD1BQ9NQG5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPRD1BQ9NQG5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPRD1BQ9NQG5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPRD1BQ9NQG5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPRD1BQ9NQG5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPRD1BQ9NQG5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPRD1BQ9NQG5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPRD1BQ9NQG5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPRD1BQ9NQG5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RPRD1BQ9NQG5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPRD1BQ9NQG5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPRD1BQ9NQG5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPRD1BQ9NQG5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPRD1BQ9NQG5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPRD1BQ9NQG5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPRD1BQ9NQG5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPRD1BQ9NQG5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPRD1BQ9NQG5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RPRD1BQ9NQG5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPRD1BQ9NQG5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPRD1BQ9NQG5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPRD1BQ9NQG5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPRD1BQ9NQG5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPRD1BQ9NQG5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPRD1BQ9NQG5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPRD1BQ9NQG5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPRD1BQ9NQG5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPRD1BQ9NQG5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPRD1BQ9NQG5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPRD1BQ9NQG5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPRD1BQ9NQG5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPRD1BQ9NQG5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPRD1BQ9NQG5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPRD1BQ9NQG5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPRD1BQ9NQG5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPRD1BQ9NQG5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPRD1BQ9NQG5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPRD1BQ9NQG5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPRD1BQ9NQG5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPRD1BQ9NQG5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPRD1BQ9NQG5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPRD1BQ9NQG5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPRD1BQ9NQG5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPRD1BQ9NQG5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPRD1BQ9NQG5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPRD1BQ9NQG5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPRD1BQ9NQG5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPRD1BQ9NQG5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RPRD1BQ9NQG5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPRD1BQ9NQG5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPRD1BQ9NQG5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPRD1BQ9NQG5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPRD1BQ9NQG5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPRD1BQ9NQG5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPRD1BQ9NQG5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPRD1BQ9NQG5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RPRD1BQ9NQG5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPRD1BQ9NQG5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPRD1BQ9NQG5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RPRD1BQ9NQG5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPRD1BQ9NQG5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPRD1BQ9NQG5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPRD1BQ9NQG5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPRD1BQ9NQG5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPRD1BQ9NQG5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPRD1BQ9NQG5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPRD1BQ9NQG5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPRD1BQ9NQG5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPRD1BQ9NQG5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPRD1BQ9NQG5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPRD1BQ9NQG5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPRD1BQ9NQG5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPRD1BQ9NQG5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPRD1BQ9NQG5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RPRD1BQ9NQG5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPRD1BQ9NQG5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPRD1BQ9NQG5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms