Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC3

CCNB1IP1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNB1IP1Q9NPC3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNB1IP1Q9NPC3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNB1IP1Q9NPC3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNB1IP1Q9NPC3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNB1IP1Q9NPC3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNB1IP1Q9NPC3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNB1IP1Q9NPC3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNB1IP1Q9NPC3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNB1IP1Q9NPC3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNB1IP1Q9NPC3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNB1IP1Q9NPC3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNB1IP1Q9NPC3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNB1IP1Q9NPC3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNB1IP1Q9NPC3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNB1IP1Q9NPC3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNB1IP1Q9NPC3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNB1IP1Q9NPC3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCNB1IP1Q9NPC3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCNB1IP1Q9NPC3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNB1IP1Q9NPC3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNB1IP1Q9NPC3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNB1IP1Q9NPC3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNB1IP1Q9NPC3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNB1IP1Q9NPC3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNB1IP1Q9NPC3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNB1IP1Q9NPC3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNB1IP1Q9NPC3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNB1IP1Q9NPC3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNB1IP1Q9NPC3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNB1IP1Q9NPC3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNB1IP1Q9NPC3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNB1IP1Q9NPC3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNB1IP1Q9NPC3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNB1IP1Q9NPC3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNB1IP1Q9NPC3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNB1IP1Q9NPC3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNB1IP1Q9NPC3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNB1IP1Q9NPC3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNB1IP1Q9NPC3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNB1IP1Q9NPC3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNB1IP1Q9NPC3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNB1IP1Q9NPC3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNB1IP1Q9NPC3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNB1IP1Q9NPC3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNB1IP1Q9NPC3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNB1IP1Q9NPC3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNB1IP1Q9NPC3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNB1IP1Q9NPC3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNB1IP1Q9NPC3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNB1IP1Q9NPC3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNB1IP1Q9NPC3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNB1IP1Q9NPC3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNB1IP1Q9NPC3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNB1IP1Q9NPC3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNB1IP1Q9NPC3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNB1IP1Q9NPC3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNB1IP1Q9NPC3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNB1IP1Q9NPC3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNB1IP1Q9NPC3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNB1IP1Q9NPC3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNB1IP1Q9NPC3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNB1IP1Q9NPC3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNB1IP1Q9NPC3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNB1IP1Q9NPC3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNB1IP1Q9NPC3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNB1IP1Q9NPC3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNB1IP1Q9NPC3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNB1IP1Q9NPC3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNB1IP1Q9NPC3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNB1IP1Q9NPC3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNB1IP1Q9NPC3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNB1IP1Q9NPC3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNB1IP1Q9NPC3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNB1IP1Q9NPC3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNB1IP1Q9NPC3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNB1IP1Q9NPC3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNB1IP1Q9NPC3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNB1IP1Q9NPC3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNB1IP1Q9NPC3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNB1IP1Q9NPC3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNB1IP1Q9NPC3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNB1IP1Q9NPC3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNB1IP1Q9NPC3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNB1IP1Q9NPC3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNB1IP1Q9NPC3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNB1IP1Q9NPC3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNB1IP1Q9NPC3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNB1IP1Q9NPC3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNB1IP1Q9NPC3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNB1IP1Q9NPC3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNB1IP1Q9NPC3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNB1IP1Q9NPC3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNB1IP1Q9NPC3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNB1IP1Q9NPC3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms