Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP85

NPHS2, Podocin, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHS2Q9NP85 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPHS2Q9NP85 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPHS2Q9NP85 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPHS2Q9NP85 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPHS2Q9NP85 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPHS2Q9NP85 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPHS2Q9NP85 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPHS2Q9NP85 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPHS2Q9NP85 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPHS2Q9NP85 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPHS2Q9NP85 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NPHS2Q9NP85 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPHS2Q9NP85 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPHS2Q9NP85 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPHS2Q9NP85 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPHS2Q9NP85 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPHS2Q9NP85 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPHS2Q9NP85 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPHS2Q9NP85 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPHS2Q9NP85 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPHS2Q9NP85 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPHS2Q9NP85 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPHS2Q9NP85 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPHS2Q9NP85 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPHS2Q9NP85 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPHS2Q9NP85 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPHS2Q9NP85 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPHS2Q9NP85 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPHS2Q9NP85 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPHS2Q9NP85 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPHS2Q9NP85 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPHS2Q9NP85 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPHS2Q9NP85 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPHS2Q9NP85 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPHS2Q9NP85 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPHS2Q9NP85 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPHS2Q9NP85 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPHS2Q9NP85 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPHS2Q9NP85 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPHS2Q9NP85 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPHS2Q9NP85 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPHS2Q9NP85 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NPHS2Q9NP85 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPHS2Q9NP85 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPHS2Q9NP85 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPHS2Q9NP85 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPHS2Q9NP85 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPHS2Q9NP85 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPHS2Q9NP85 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPHS2Q9NP85 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPHS2Q9NP85 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPHS2Q9NP85 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPHS2Q9NP85 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPHS2Q9NP85 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPHS2Q9NP85 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPHS2Q9NP85 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPHS2Q9NP85 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPHS2Q9NP85 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPHS2Q9NP85 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPHS2Q9NP85 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPHS2Q9NP85 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPHS2Q9NP85 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPHS2Q9NP85 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPHS2Q9NP85 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPHS2Q9NP85 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPHS2Q9NP85 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPHS2Q9NP85 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPHS2Q9NP85 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPHS2Q9NP85 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPHS2Q9NP85 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPHS2Q9NP85 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPHS2Q9NP85 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPHS2Q9NP85 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPHS2Q9NP85 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPHS2Q9NP85 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPHS2Q9NP85 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPHS2Q9NP85 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPHS2Q9NP85 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPHS2Q9NP85 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPHS2Q9NP85 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPHS2Q9NP85 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPHS2Q9NP85 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPHS2Q9NP85 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPHS2Q9NP85 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NPHS2Q9NP85 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPHS2Q9NP85 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPHS2Q9NP85 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPHS2Q9NP85 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPHS2Q9NP85 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPHS2Q9NP85 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NPHS2Q9NP85 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NPHS2Q9NP85 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPHS2Q9NP85 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPHS2Q9NP85 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPHS2Q9NP85 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPHS2Q9NP85 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPHS2Q9NP85 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPHS2Q9NP85 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPHS2Q9NP85 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NPHS2Q9NP85 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.2 ms