Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BPIFA1Q9NP55 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BPIFA1Q9NP55 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BPIFA1Q9NP55 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BPIFA1Q9NP55 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BPIFA1Q9NP55 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
BPIFA1Q9NP55 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BPIFA1Q9NP55 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BPIFA1Q9NP55 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BPIFA1Q9NP55 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BPIFA1Q9NP55 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BPIFA1Q9NP55 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BPIFA1Q9NP55 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BPIFA1Q9NP55 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BPIFA1Q9NP55 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BPIFA1Q9NP55 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BPIFA1Q9NP55 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BPIFA1Q9NP55 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BPIFA1Q9NP55 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BPIFA1Q9NP55 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BPIFA1Q9NP55 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BPIFA1Q9NP55 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BPIFA1Q9NP55 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BPIFA1Q9NP55 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BPIFA1Q9NP55 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BPIFA1Q9NP55 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BPIFA1Q9NP55 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BPIFA1Q9NP55 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BPIFA1Q9NP55 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BPIFA1Q9NP55 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BPIFA1Q9NP55 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BPIFA1Q9NP55 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BPIFA1Q9NP55 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BPIFA1Q9NP55 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BPIFA1Q9NP55 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BPIFA1Q9NP55 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BPIFA1Q9NP55 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BPIFA1Q9NP55 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BPIFA1Q9NP55 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BPIFA1Q9NP55 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BPIFA1Q9NP55 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BPIFA1Q9NP55 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BPIFA1Q9NP55 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BPIFA1Q9NP55 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BPIFA1Q9NP55 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BPIFA1Q9NP55 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BPIFA1Q9NP55 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BPIFA1Q9NP55 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BPIFA1Q9NP55 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BPIFA1Q9NP55 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BPIFA1Q9NP55 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BPIFA1Q9NP55 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BPIFA1Q9NP55 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BPIFA1Q9NP55 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BPIFA1Q9NP55 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BPIFA1Q9NP55 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BPIFA1Q9NP55 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BPIFA1Q9NP55 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BPIFA1Q9NP55 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BPIFA1Q9NP55 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BPIFA1Q9NP55 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BPIFA1Q9NP55 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BPIFA1Q9NP55 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BPIFA1Q9NP55 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BPIFA1Q9NP55 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
BPIFA1Q9NP55 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BPIFA1Q9NP55 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BPIFA1Q9NP55 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
BPIFA1Q9NP55 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BPIFA1Q9NP55 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
BPIFA1Q9NP55 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BPIFA1Q9NP55 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
BPIFA1Q9NP55 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BPIFA1Q9NP55 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BPIFA1Q9NP55 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
BPIFA1Q9NP55 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BPIFA1Q9NP55 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BPIFA1Q9NP55 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BPIFA1Q9NP55 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
BPIFA1Q9NP55 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BPIFA1Q9NP55 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BPIFA1Q9NP55 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BPIFA1Q9NP55 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BPIFA1Q9NP55 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BPIFA1Q9NP55 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BPIFA1Q9NP55 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BPIFA1Q9NP55 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BPIFA1Q9NP55 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BPIFA1Q9NP55 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BPIFA1Q9NP55 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BPIFA1Q9NP55 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BPIFA1Q9NP55 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BPIFA1Q9NP55 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BPIFA1Q9NP55 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BPIFA1Q9NP55 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BPIFA1Q9NP55 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BPIFA1Q9NP55 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BPIFA1Q9NP55 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BPIFA1Q9NP55 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BPIFA1Q9NP55 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1196.3 ms