Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS5

EPB41L4A, Band 4.1-like protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L4AQ9HCS5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
EPB41L4AQ9HCS5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
EPB41L4AQ9HCS5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
EPB41L4AQ9HCS5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
EPB41L4AQ9HCS5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
EPB41L4AQ9HCS5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
EPB41L4AQ9HCS5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
EPB41L4AQ9HCS5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
EPB41L4AQ9HCS5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
EPB41L4AQ9HCS5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
EPB41L4AQ9HCS5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
EPB41L4AQ9HCS5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
EPB41L4AQ9HCS5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
EPB41L4AQ9HCS5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
EPB41L4AQ9HCS5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
EPB41L4AQ9HCS5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
EPB41L4AQ9HCS5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
EPB41L4AQ9HCS5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
EPB41L4AQ9HCS5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
EPB41L4AQ9HCS5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
EPB41L4AQ9HCS5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
EPB41L4AQ9HCS5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
EPB41L4AQ9HCS5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
EPB41L4AQ9HCS5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
EPB41L4AQ9HCS5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
EPB41L4AQ9HCS5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
EPB41L4AQ9HCS5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
EPB41L4AQ9HCS5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
EPB41L4AQ9HCS5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
EPB41L4AQ9HCS5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
EPB41L4AQ9HCS5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
EPB41L4AQ9HCS5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
EPB41L4AQ9HCS5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
EPB41L4AQ9HCS5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
EPB41L4AQ9HCS5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
EPB41L4AQ9HCS5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
EPB41L4AQ9HCS5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
EPB41L4AQ9HCS5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
EPB41L4AQ9HCS5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
EPB41L4AQ9HCS5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
EPB41L4AQ9HCS5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
EPB41L4AQ9HCS5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
EPB41L4AQ9HCS5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
EPB41L4AQ9HCS5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
EPB41L4AQ9HCS5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
EPB41L4AQ9HCS5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
EPB41L4AQ9HCS5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
EPB41L4AQ9HCS5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
EPB41L4AQ9HCS5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
EPB41L4AQ9HCS5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
EPB41L4AQ9HCS5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
EPB41L4AQ9HCS5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
EPB41L4AQ9HCS5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
EPB41L4AQ9HCS5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
EPB41L4AQ9HCS5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
EPB41L4AQ9HCS5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
EPB41L4AQ9HCS5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
EPB41L4AQ9HCS5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
EPB41L4AQ9HCS5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
EPB41L4AQ9HCS5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
EPB41L4AQ9HCS5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EPB41L4AQ9HCS5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EPB41L4AQ9HCS5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
EPB41L4AQ9HCS5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EPB41L4AQ9HCS5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EPB41L4AQ9HCS5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EPB41L4AQ9HCS5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
EPB41L4AQ9HCS5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
EPB41L4AQ9HCS5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
EPB41L4AQ9HCS5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EPB41L4AQ9HCS5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
EPB41L4AQ9HCS5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EPB41L4AQ9HCS5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
EPB41L4AQ9HCS5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
EPB41L4AQ9HCS5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
EPB41L4AQ9HCS5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
EPB41L4AQ9HCS5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
EPB41L4AQ9HCS5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
EPB41L4AQ9HCS5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
EPB41L4AQ9HCS5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
EPB41L4AQ9HCS5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
EPB41L4AQ9HCS5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EPB41L4AQ9HCS5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
EPB41L4AQ9HCS5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EPB41L4AQ9HCS5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EPB41L4AQ9HCS5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EPB41L4AQ9HCS5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EPB41L4AQ9HCS5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
EPB41L4AQ9HCS5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
EPB41L4AQ9HCS5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
EPB41L4AQ9HCS5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EPB41L4AQ9HCS5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
EPB41L4AQ9HCS5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
EPB41L4AQ9HCS5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
EPB41L4AQ9HCS5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
EPB41L4AQ9HCS5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
EPB41L4AQ9HCS5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
EPB41L4AQ9HCS5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EPB41L4AQ9HCS5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
EPB41L4AQ9HCS5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms