Protein–RNA interactions for Protein: Q9H944

MED20, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED20Q9H944 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED20Q9H944 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED20Q9H944 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED20Q9H944 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED20Q9H944 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED20Q9H944 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED20Q9H944 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MED20Q9H944 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
MED20Q9H944 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED20Q9H944 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED20Q9H944 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED20Q9H944 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED20Q9H944 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED20Q9H944 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED20Q9H944 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MED20Q9H944 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED20Q9H944 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED20Q9H944 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED20Q9H944 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED20Q9H944 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED20Q9H944 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED20Q9H944 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MED20Q9H944 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED20Q9H944 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED20Q9H944 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED20Q9H944 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED20Q9H944 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED20Q9H944 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED20Q9H944 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED20Q9H944 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED20Q9H944 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED20Q9H944 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED20Q9H944 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED20Q9H944 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED20Q9H944 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED20Q9H944 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED20Q9H944 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED20Q9H944 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED20Q9H944 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED20Q9H944 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED20Q9H944 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED20Q9H944 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED20Q9H944 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED20Q9H944 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED20Q9H944 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED20Q9H944 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED20Q9H944 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MED20Q9H944 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MED20Q9H944 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MED20Q9H944 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MED20Q9H944 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MED20Q9H944 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MED20Q9H944 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED20Q9H944 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED20Q9H944 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED20Q9H944 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED20Q9H944 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED20Q9H944 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED20Q9H944 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED20Q9H944 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED20Q9H944 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED20Q9H944 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED20Q9H944 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED20Q9H944 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED20Q9H944 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED20Q9H944 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED20Q9H944 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED20Q9H944 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED20Q9H944 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED20Q9H944 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MED20Q9H944 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED20Q9H944 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED20Q9H944 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED20Q9H944 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED20Q9H944 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED20Q9H944 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED20Q9H944 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED20Q9H944 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED20Q9H944 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED20Q9H944 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED20Q9H944 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED20Q9H944 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED20Q9H944 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED20Q9H944 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED20Q9H944 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED20Q9H944 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED20Q9H944 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED20Q9H944 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED20Q9H944 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED20Q9H944 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED20Q9H944 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED20Q9H944 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED20Q9H944 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED20Q9H944 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED20Q9H944 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MED20Q9H944 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MED20Q9H944 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MED20Q9H944 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MED20Q9H944 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MED20Q9H944 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 480.6 ms