Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GFRA4Q9GZZ7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GFRA4Q9GZZ7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GFRA4Q9GZZ7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GFRA4Q9GZZ7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GFRA4Q9GZZ7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GFRA4Q9GZZ7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GFRA4Q9GZZ7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GFRA4Q9GZZ7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GFRA4Q9GZZ7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GFRA4Q9GZZ7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GFRA4Q9GZZ7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GFRA4Q9GZZ7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GFRA4Q9GZZ7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GFRA4Q9GZZ7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GFRA4Q9GZZ7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GFRA4Q9GZZ7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GFRA4Q9GZZ7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GFRA4Q9GZZ7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GFRA4Q9GZZ7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GFRA4Q9GZZ7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GFRA4Q9GZZ7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GFRA4Q9GZZ7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GFRA4Q9GZZ7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GFRA4Q9GZZ7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GFRA4Q9GZZ7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GFRA4Q9GZZ7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GFRA4Q9GZZ7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GFRA4Q9GZZ7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GFRA4Q9GZZ7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GFRA4Q9GZZ7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GFRA4Q9GZZ7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GFRA4Q9GZZ7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GFRA4Q9GZZ7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GFRA4Q9GZZ7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GFRA4Q9GZZ7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GFRA4Q9GZZ7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GFRA4Q9GZZ7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GFRA4Q9GZZ7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GFRA4Q9GZZ7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GFRA4Q9GZZ7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GFRA4Q9GZZ7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GFRA4Q9GZZ7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GFRA4Q9GZZ7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GFRA4Q9GZZ7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GFRA4Q9GZZ7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GFRA4Q9GZZ7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GFRA4Q9GZZ7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GFRA4Q9GZZ7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GFRA4Q9GZZ7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GFRA4Q9GZZ7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GFRA4Q9GZZ7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GFRA4Q9GZZ7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GFRA4Q9GZZ7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GFRA4Q9GZZ7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GFRA4Q9GZZ7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GFRA4Q9GZZ7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GFRA4Q9GZZ7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GFRA4Q9GZZ7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GFRA4Q9GZZ7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GFRA4Q9GZZ7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GFRA4Q9GZZ7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GFRA4Q9GZZ7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GFRA4Q9GZZ7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GFRA4Q9GZZ7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GFRA4Q9GZZ7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GFRA4Q9GZZ7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GFRA4Q9GZZ7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GFRA4Q9GZZ7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GFRA4Q9GZZ7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GFRA4Q9GZZ7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GFRA4Q9GZZ7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GFRA4Q9GZZ7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GFRA4Q9GZZ7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GFRA4Q9GZZ7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GFRA4Q9GZZ7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GFRA4Q9GZZ7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GFRA4Q9GZZ7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GFRA4Q9GZZ7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GFRA4Q9GZZ7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GFRA4Q9GZZ7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GFRA4Q9GZZ7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GFRA4Q9GZZ7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GFRA4Q9GZZ7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GFRA4Q9GZZ7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GFRA4Q9GZZ7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GFRA4Q9GZZ7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFRA4Q9GZZ7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFRA4Q9GZZ7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFRA4Q9GZZ7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFRA4Q9GZZ7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFRA4Q9GZZ7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFRA4Q9GZZ7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFRA4Q9GZZ7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFRA4Q9GZZ7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFRA4Q9GZZ7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFRA4Q9GZZ7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFRA4Q9GZZ7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFRA4Q9GZZ7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFRA4Q9GZZ7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms