Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT4

SRR, Serine racemase, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRQ9GZT4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRRQ9GZT4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRRQ9GZT4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRRQ9GZT4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRRQ9GZT4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRRQ9GZT4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRRQ9GZT4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRRQ9GZT4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRRQ9GZT4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SRRQ9GZT4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRRQ9GZT4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRRQ9GZT4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRRQ9GZT4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRRQ9GZT4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRRQ9GZT4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRRQ9GZT4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRRQ9GZT4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRRQ9GZT4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SRRQ9GZT4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRRQ9GZT4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRRQ9GZT4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRRQ9GZT4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRRQ9GZT4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRRQ9GZT4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRRQ9GZT4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRRQ9GZT4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRRQ9GZT4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRRQ9GZT4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRRQ9GZT4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRRQ9GZT4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRRQ9GZT4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRRQ9GZT4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRRQ9GZT4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRRQ9GZT4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRRQ9GZT4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRRQ9GZT4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRRQ9GZT4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRRQ9GZT4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRRQ9GZT4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRRQ9GZT4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRRQ9GZT4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRRQ9GZT4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRRQ9GZT4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRRQ9GZT4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRRQ9GZT4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRRQ9GZT4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRRQ9GZT4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRRQ9GZT4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SRRQ9GZT4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SRRQ9GZT4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SRRQ9GZT4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SRRQ9GZT4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRRQ9GZT4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRRQ9GZT4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRRQ9GZT4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRRQ9GZT4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRRQ9GZT4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRRQ9GZT4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRRQ9GZT4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRRQ9GZT4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRRQ9GZT4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRRQ9GZT4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRRQ9GZT4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRRQ9GZT4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRRQ9GZT4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRRQ9GZT4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRRQ9GZT4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRRQ9GZT4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRRQ9GZT4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRRQ9GZT4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRRQ9GZT4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRRQ9GZT4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRRQ9GZT4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRRQ9GZT4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRRQ9GZT4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SRRQ9GZT4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRRQ9GZT4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRRQ9GZT4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRRQ9GZT4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRRQ9GZT4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRRQ9GZT4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRRQ9GZT4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRRQ9GZT4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRRQ9GZT4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRRQ9GZT4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRRQ9GZT4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SRRQ9GZT4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRRQ9GZT4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRRQ9GZT4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRRQ9GZT4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SRRQ9GZT4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SRRQ9GZT4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SRRQ9GZT4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRRQ9GZT4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRRQ9GZT4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRRQ9GZT4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SRRQ9GZT4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRRQ9GZT4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SRRQ9GZT4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SRRQ9GZT4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.3 ms