Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EDEM3Q9BZQ6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EDEM3Q9BZQ6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EDEM3Q9BZQ6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EDEM3Q9BZQ6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EDEM3Q9BZQ6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EDEM3Q9BZQ6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EDEM3Q9BZQ6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EDEM3Q9BZQ6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
EDEM3Q9BZQ6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
EDEM3Q9BZQ6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
EDEM3Q9BZQ6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EDEM3Q9BZQ6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EDEM3Q9BZQ6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EDEM3Q9BZQ6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
EDEM3Q9BZQ6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
EDEM3Q9BZQ6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
EDEM3Q9BZQ6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
EDEM3Q9BZQ6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
EDEM3Q9BZQ6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EDEM3Q9BZQ6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EDEM3Q9BZQ6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EDEM3Q9BZQ6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EDEM3Q9BZQ6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EDEM3Q9BZQ6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EDEM3Q9BZQ6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EDEM3Q9BZQ6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EDEM3Q9BZQ6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EDEM3Q9BZQ6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EDEM3Q9BZQ6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EDEM3Q9BZQ6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EDEM3Q9BZQ6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EDEM3Q9BZQ6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EDEM3Q9BZQ6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
EDEM3Q9BZQ6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EDEM3Q9BZQ6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EDEM3Q9BZQ6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EDEM3Q9BZQ6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EDEM3Q9BZQ6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EDEM3Q9BZQ6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EDEM3Q9BZQ6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EDEM3Q9BZQ6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EDEM3Q9BZQ6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EDEM3Q9BZQ6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EDEM3Q9BZQ6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EDEM3Q9BZQ6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EDEM3Q9BZQ6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
EDEM3Q9BZQ6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EDEM3Q9BZQ6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EDEM3Q9BZQ6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EDEM3Q9BZQ6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
EDEM3Q9BZQ6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EDEM3Q9BZQ6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EDEM3Q9BZQ6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EDEM3Q9BZQ6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EDEM3Q9BZQ6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EDEM3Q9BZQ6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EDEM3Q9BZQ6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EDEM3Q9BZQ6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EDEM3Q9BZQ6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EDEM3Q9BZQ6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EDEM3Q9BZQ6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EDEM3Q9BZQ6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EDEM3Q9BZQ6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EDEM3Q9BZQ6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EDEM3Q9BZQ6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EDEM3Q9BZQ6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EDEM3Q9BZQ6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EDEM3Q9BZQ6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
EDEM3Q9BZQ6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EDEM3Q9BZQ6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EDEM3Q9BZQ6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EDEM3Q9BZQ6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EDEM3Q9BZQ6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EDEM3Q9BZQ6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EDEM3Q9BZQ6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EDEM3Q9BZQ6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
EDEM3Q9BZQ6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
EDEM3Q9BZQ6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
EDEM3Q9BZQ6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
EDEM3Q9BZQ6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
EDEM3Q9BZQ6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
EDEM3Q9BZQ6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
EDEM3Q9BZQ6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
EDEM3Q9BZQ6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
EDEM3Q9BZQ6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
EDEM3Q9BZQ6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EDEM3Q9BZQ6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EDEM3Q9BZQ6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EDEM3Q9BZQ6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EDEM3Q9BZQ6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EDEM3Q9BZQ6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EDEM3Q9BZQ6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EDEM3Q9BZQ6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EDEM3Q9BZQ6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EDEM3Q9BZQ6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EDEM3Q9BZQ6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EDEM3Q9BZQ6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EDEM3Q9BZQ6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EDEM3Q9BZQ6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms