Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDF1Q9BYJ9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YTHDF1Q9BYJ9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YTHDF1Q9BYJ9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YTHDF1Q9BYJ9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YTHDF1Q9BYJ9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YTHDF1Q9BYJ9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YTHDF1Q9BYJ9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
YTHDF1Q9BYJ9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
YTHDF1Q9BYJ9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YTHDF1Q9BYJ9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YTHDF1Q9BYJ9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
YTHDF1Q9BYJ9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
YTHDF1Q9BYJ9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YTHDF1Q9BYJ9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YTHDF1Q9BYJ9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YTHDF1Q9BYJ9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YTHDF1Q9BYJ9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YTHDF1Q9BYJ9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YTHDF1Q9BYJ9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
YTHDF1Q9BYJ9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
YTHDF1Q9BYJ9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
YTHDF1Q9BYJ9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
YTHDF1Q9BYJ9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
YTHDF1Q9BYJ9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
YTHDF1Q9BYJ9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
YTHDF1Q9BYJ9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
YTHDF1Q9BYJ9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
YTHDF1Q9BYJ9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YTHDF1Q9BYJ9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YTHDF1Q9BYJ9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
YTHDF1Q9BYJ9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
YTHDF1Q9BYJ9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YTHDF1Q9BYJ9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
YTHDF1Q9BYJ9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YTHDF1Q9BYJ9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YTHDF1Q9BYJ9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YTHDF1Q9BYJ9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YTHDF1Q9BYJ9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YTHDF1Q9BYJ9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YTHDF1Q9BYJ9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YTHDF1Q9BYJ9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YTHDF1Q9BYJ9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
YTHDF1Q9BYJ9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YTHDF1Q9BYJ9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
YTHDF1Q9BYJ9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
YTHDF1Q9BYJ9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YTHDF1Q9BYJ9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YTHDF1Q9BYJ9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YTHDF1Q9BYJ9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YTHDF1Q9BYJ9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YTHDF1Q9BYJ9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YTHDF1Q9BYJ9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YTHDF1Q9BYJ9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
YTHDF1Q9BYJ9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YTHDF1Q9BYJ9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
YTHDF1Q9BYJ9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
YTHDF1Q9BYJ9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
YTHDF1Q9BYJ9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
YTHDF1Q9BYJ9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
YTHDF1Q9BYJ9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
YTHDF1Q9BYJ9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YTHDF1Q9BYJ9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YTHDF1Q9BYJ9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
YTHDF1Q9BYJ9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YTHDF1Q9BYJ9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
YTHDF1Q9BYJ9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YTHDF1Q9BYJ9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YTHDF1Q9BYJ9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YTHDF1Q9BYJ9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
YTHDF1Q9BYJ9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YTHDF1Q9BYJ9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
YTHDF1Q9BYJ9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
YTHDF1Q9BYJ9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
YTHDF1Q9BYJ9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YTHDF1Q9BYJ9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
YTHDF1Q9BYJ9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
YTHDF1Q9BYJ9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
YTHDF1Q9BYJ9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YTHDF1Q9BYJ9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YTHDF1Q9BYJ9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YTHDF1Q9BYJ9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YTHDF1Q9BYJ9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YTHDF1Q9BYJ9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YTHDF1Q9BYJ9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YTHDF1Q9BYJ9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
YTHDF1Q9BYJ9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YTHDF1Q9BYJ9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YTHDF1Q9BYJ9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YTHDF1Q9BYJ9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YTHDF1Q9BYJ9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YTHDF1Q9BYJ9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YTHDF1Q9BYJ9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YTHDF1Q9BYJ9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YTHDF1Q9BYJ9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YTHDF1Q9BYJ9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YTHDF1Q9BYJ9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YTHDF1Q9BYJ9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YTHDF1Q9BYJ9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms