Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY77

POLDIP3, Polymerase delta-interacting protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLDIP3Q9BY77 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
POLDIP3Q9BY77 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLDIP3Q9BY77 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLDIP3Q9BY77 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLDIP3Q9BY77 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLDIP3Q9BY77 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLDIP3Q9BY77 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLDIP3Q9BY77 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
POLDIP3Q9BY77 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLDIP3Q9BY77 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLDIP3Q9BY77 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLDIP3Q9BY77 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLDIP3Q9BY77 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLDIP3Q9BY77 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLDIP3Q9BY77 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLDIP3Q9BY77 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLDIP3Q9BY77 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLDIP3Q9BY77 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLDIP3Q9BY77 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLDIP3Q9BY77 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLDIP3Q9BY77 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLDIP3Q9BY77 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLDIP3Q9BY77 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLDIP3Q9BY77 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLDIP3Q9BY77 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLDIP3Q9BY77 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLDIP3Q9BY77 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLDIP3Q9BY77 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLDIP3Q9BY77 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLDIP3Q9BY77 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLDIP3Q9BY77 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLDIP3Q9BY77 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLDIP3Q9BY77 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLDIP3Q9BY77 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLDIP3Q9BY77 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLDIP3Q9BY77 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLDIP3Q9BY77 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLDIP3Q9BY77 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLDIP3Q9BY77 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLDIP3Q9BY77 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLDIP3Q9BY77 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLDIP3Q9BY77 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLDIP3Q9BY77 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLDIP3Q9BY77 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLDIP3Q9BY77 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLDIP3Q9BY77 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLDIP3Q9BY77 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLDIP3Q9BY77 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
POLDIP3Q9BY77 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLDIP3Q9BY77 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
POLDIP3Q9BY77 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLDIP3Q9BY77 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLDIP3Q9BY77 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLDIP3Q9BY77 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLDIP3Q9BY77 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLDIP3Q9BY77 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLDIP3Q9BY77 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLDIP3Q9BY77 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLDIP3Q9BY77 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLDIP3Q9BY77 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLDIP3Q9BY77 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLDIP3Q9BY77 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLDIP3Q9BY77 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLDIP3Q9BY77 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLDIP3Q9BY77 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
POLDIP3Q9BY77 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLDIP3Q9BY77 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLDIP3Q9BY77 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLDIP3Q9BY77 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLDIP3Q9BY77 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLDIP3Q9BY77 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLDIP3Q9BY77 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLDIP3Q9BY77 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLDIP3Q9BY77 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLDIP3Q9BY77 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLDIP3Q9BY77 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLDIP3Q9BY77 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLDIP3Q9BY77 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLDIP3Q9BY77 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLDIP3Q9BY77 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLDIP3Q9BY77 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLDIP3Q9BY77 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLDIP3Q9BY77 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLDIP3Q9BY77 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLDIP3Q9BY77 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLDIP3Q9BY77 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLDIP3Q9BY77 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLDIP3Q9BY77 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLDIP3Q9BY77 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLDIP3Q9BY77 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
POLDIP3Q9BY77 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLDIP3Q9BY77 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLDIP3Q9BY77 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLDIP3Q9BY77 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLDIP3Q9BY77 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLDIP3Q9BY77 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLDIP3Q9BY77 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLDIP3Q9BY77 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLDIP3Q9BY77 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLDIP3Q9BY77 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms