Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVK6

TMED9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED9Q9BVK6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMED9Q9BVK6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMED9Q9BVK6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMED9Q9BVK6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMED9Q9BVK6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMED9Q9BVK6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMED9Q9BVK6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMED9Q9BVK6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMED9Q9BVK6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMED9Q9BVK6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMED9Q9BVK6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMED9Q9BVK6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMED9Q9BVK6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMED9Q9BVK6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMED9Q9BVK6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMED9Q9BVK6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMED9Q9BVK6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMED9Q9BVK6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMED9Q9BVK6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMED9Q9BVK6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMED9Q9BVK6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMED9Q9BVK6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMED9Q9BVK6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMED9Q9BVK6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMED9Q9BVK6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMED9Q9BVK6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMED9Q9BVK6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TMED9Q9BVK6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMED9Q9BVK6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMED9Q9BVK6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMED9Q9BVK6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMED9Q9BVK6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMED9Q9BVK6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMED9Q9BVK6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TMED9Q9BVK6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMED9Q9BVK6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMED9Q9BVK6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMED9Q9BVK6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMED9Q9BVK6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMED9Q9BVK6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMED9Q9BVK6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMED9Q9BVK6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMED9Q9BVK6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMED9Q9BVK6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMED9Q9BVK6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TMED9Q9BVK6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMED9Q9BVK6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TMED9Q9BVK6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMED9Q9BVK6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TMED9Q9BVK6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMED9Q9BVK6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMED9Q9BVK6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMED9Q9BVK6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMED9Q9BVK6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMED9Q9BVK6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMED9Q9BVK6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMED9Q9BVK6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMED9Q9BVK6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMED9Q9BVK6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMED9Q9BVK6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMED9Q9BVK6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMED9Q9BVK6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMED9Q9BVK6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMED9Q9BVK6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMED9Q9BVK6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMED9Q9BVK6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMED9Q9BVK6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMED9Q9BVK6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMED9Q9BVK6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMED9Q9BVK6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMED9Q9BVK6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMED9Q9BVK6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMED9Q9BVK6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMED9Q9BVK6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMED9Q9BVK6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TMED9Q9BVK6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMED9Q9BVK6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMED9Q9BVK6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMED9Q9BVK6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMED9Q9BVK6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMED9Q9BVK6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMED9Q9BVK6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMED9Q9BVK6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMED9Q9BVK6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMED9Q9BVK6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMED9Q9BVK6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMED9Q9BVK6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMED9Q9BVK6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TMED9Q9BVK6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMED9Q9BVK6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMED9Q9BVK6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMED9Q9BVK6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMED9Q9BVK6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMED9Q9BVK6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMED9Q9BVK6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMED9Q9BVK6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMED9Q9BVK6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMED9Q9BVK6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMED9Q9BVK6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMED9Q9BVK6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 234.6 ms