Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRR3

TMEM246, Transmembrane protein 246, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM246Q9BRR3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM246Q9BRR3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM246Q9BRR3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM246Q9BRR3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM246Q9BRR3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM246Q9BRR3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM246Q9BRR3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM246Q9BRR3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM246Q9BRR3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM246Q9BRR3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM246Q9BRR3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM246Q9BRR3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM246Q9BRR3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM246Q9BRR3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM246Q9BRR3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM246Q9BRR3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM246Q9BRR3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM246Q9BRR3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM246Q9BRR3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TMEM246Q9BRR3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM246Q9BRR3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM246Q9BRR3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM246Q9BRR3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM246Q9BRR3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM246Q9BRR3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM246Q9BRR3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM246Q9BRR3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM246Q9BRR3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM246Q9BRR3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM246Q9BRR3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM246Q9BRR3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM246Q9BRR3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM246Q9BRR3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM246Q9BRR3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM246Q9BRR3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM246Q9BRR3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM246Q9BRR3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM246Q9BRR3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM246Q9BRR3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM246Q9BRR3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM246Q9BRR3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM246Q9BRR3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM246Q9BRR3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM246Q9BRR3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM246Q9BRR3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM246Q9BRR3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM246Q9BRR3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM246Q9BRR3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM246Q9BRR3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM246Q9BRR3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM246Q9BRR3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM246Q9BRR3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM246Q9BRR3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM246Q9BRR3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM246Q9BRR3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM246Q9BRR3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM246Q9BRR3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM246Q9BRR3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM246Q9BRR3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM246Q9BRR3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM246Q9BRR3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM246Q9BRR3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM246Q9BRR3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM246Q9BRR3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM246Q9BRR3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM246Q9BRR3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM246Q9BRR3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM246Q9BRR3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM246Q9BRR3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM246Q9BRR3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM246Q9BRR3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM246Q9BRR3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM246Q9BRR3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM246Q9BRR3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM246Q9BRR3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM246Q9BRR3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM246Q9BRR3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM246Q9BRR3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM246Q9BRR3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM246Q9BRR3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM246Q9BRR3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM246Q9BRR3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM246Q9BRR3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM246Q9BRR3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM246Q9BRR3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM246Q9BRR3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM246Q9BRR3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM246Q9BRR3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM246Q9BRR3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM246Q9BRR3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM246Q9BRR3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM246Q9BRR3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM246Q9BRR3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM246Q9BRR3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM246Q9BRR3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM246Q9BRR3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM246Q9BRR3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM246Q9BRR3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM246Q9BRR3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM246Q9BRR3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms