Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SIN3AQ96ST3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SIN3AQ96ST3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
SIN3AQ96ST3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SIN3AQ96ST3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SIN3AQ96ST3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
SIN3AQ96ST3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SIN3AQ96ST3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SIN3AQ96ST3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SIN3AQ96ST3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SIN3AQ96ST3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SIN3AQ96ST3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SIN3AQ96ST3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
SIN3AQ96ST3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SIN3AQ96ST3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SIN3AQ96ST3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SIN3AQ96ST3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
SIN3AQ96ST3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
SIN3AQ96ST3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SIN3AQ96ST3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
SIN3AQ96ST3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SIN3AQ96ST3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SIN3AQ96ST3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
SIN3AQ96ST3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SIN3AQ96ST3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
SIN3AQ96ST3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SIN3AQ96ST3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
SIN3AQ96ST3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SIN3AQ96ST3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
SIN3AQ96ST3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
SIN3AQ96ST3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
SIN3AQ96ST3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
SIN3AQ96ST3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
SIN3AQ96ST3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SIN3AQ96ST3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SIN3AQ96ST3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SIN3AQ96ST3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SIN3AQ96ST3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
SIN3AQ96ST3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
SIN3AQ96ST3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC36.09■■■■□ 3.37
SIN3AQ96ST3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SIN3AQ96ST3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.37
SIN3AQ96ST3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
SIN3AQ96ST3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
SIN3AQ96ST3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
SIN3AQ96ST3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
SIN3AQ96ST3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
SIN3AQ96ST3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
SIN3AQ96ST3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SIN3AQ96ST3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC36.06■■■■□ 3.36
SIN3AQ96ST3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SIN3AQ96ST3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SIN3AQ96ST3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SIN3AQ96ST3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SIN3AQ96ST3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SIN3AQ96ST3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SIN3AQ96ST3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
SIN3AQ96ST3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
SIN3AQ96ST3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SIN3AQ96ST3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SIN3AQ96ST3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
SIN3AQ96ST3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
SIN3AQ96ST3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
SIN3AQ96ST3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SIN3AQ96ST3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
SIN3AQ96ST3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
SIN3AQ96ST3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
SIN3AQ96ST3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
SIN3AQ96ST3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC36■■■■□ 3.35
SIN3AQ96ST3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
SIN3AQ96ST3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
SIN3AQ96ST3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
SIN3AQ96ST3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
SIN3AQ96ST3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
SIN3AQ96ST3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SIN3AQ96ST3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
SIN3AQ96ST3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
SIN3AQ96ST3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
SIN3AQ96ST3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
SIN3AQ96ST3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
SIN3AQ96ST3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
SIN3AQ96ST3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
SIN3AQ96ST3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
SIN3AQ96ST3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
SIN3AQ96ST3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SIN3AQ96ST3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SIN3AQ96ST3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SIN3AQ96ST3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SIN3AQ96ST3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
SIN3AQ96ST3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
SIN3AQ96ST3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
SIN3AQ96ST3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
SIN3AQ96ST3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
SIN3AQ96ST3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SIN3AQ96ST3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SIN3AQ96ST3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
SIN3AQ96ST3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
SIN3AQ96ST3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
SIN3AQ96ST3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
SIN3AQ96ST3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.9 ms