Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHF12Q96QT6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHF12Q96QT6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHF12Q96QT6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHF12Q96QT6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF12Q96QT6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF12Q96QT6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF12Q96QT6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHF12Q96QT6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHF12Q96QT6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHF12Q96QT6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHF12Q96QT6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHF12Q96QT6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHF12Q96QT6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHF12Q96QT6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHF12Q96QT6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHF12Q96QT6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHF12Q96QT6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF12Q96QT6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF12Q96QT6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF12Q96QT6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF12Q96QT6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHF12Q96QT6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHF12Q96QT6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHF12Q96QT6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHF12Q96QT6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHF12Q96QT6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHF12Q96QT6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHF12Q96QT6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHF12Q96QT6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHF12Q96QT6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHF12Q96QT6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHF12Q96QT6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHF12Q96QT6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHF12Q96QT6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHF12Q96QT6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHF12Q96QT6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHF12Q96QT6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHF12Q96QT6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHF12Q96QT6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHF12Q96QT6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PHF12Q96QT6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHF12Q96QT6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHF12Q96QT6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHF12Q96QT6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHF12Q96QT6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHF12Q96QT6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHF12Q96QT6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHF12Q96QT6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF12Q96QT6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF12Q96QT6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF12Q96QT6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF12Q96QT6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF12Q96QT6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF12Q96QT6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF12Q96QT6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF12Q96QT6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF12Q96QT6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF12Q96QT6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF12Q96QT6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF12Q96QT6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHF12Q96QT6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHF12Q96QT6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHF12Q96QT6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHF12Q96QT6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHF12Q96QT6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHF12Q96QT6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHF12Q96QT6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF12Q96QT6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF12Q96QT6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF12Q96QT6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF12Q96QT6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF12Q96QT6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF12Q96QT6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF12Q96QT6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF12Q96QT6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF12Q96QT6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF12Q96QT6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF12Q96QT6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF12Q96QT6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHF12Q96QT6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHF12Q96QT6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHF12Q96QT6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHF12Q96QT6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHF12Q96QT6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PHF12Q96QT6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF12Q96QT6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF12Q96QT6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF12Q96QT6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHF12Q96QT6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHF12Q96QT6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHF12Q96QT6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHF12Q96QT6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHF12Q96QT6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PHF12Q96QT6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHF12Q96QT6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF12Q96QT6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF12Q96QT6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF12Q96QT6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF12Q96QT6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.5 ms