Protein–RNA interactions for Protein: Q96NJ6

ZFP3, Zinc finger protein 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFP3Q96NJ6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZFP3Q96NJ6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZFP3Q96NJ6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZFP3Q96NJ6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZFP3Q96NJ6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZFP3Q96NJ6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZFP3Q96NJ6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZFP3Q96NJ6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZFP3Q96NJ6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZFP3Q96NJ6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZFP3Q96NJ6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZFP3Q96NJ6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZFP3Q96NJ6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZFP3Q96NJ6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZFP3Q96NJ6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZFP3Q96NJ6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZFP3Q96NJ6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZFP3Q96NJ6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZFP3Q96NJ6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZFP3Q96NJ6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZFP3Q96NJ6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZFP3Q96NJ6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZFP3Q96NJ6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZFP3Q96NJ6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZFP3Q96NJ6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZFP3Q96NJ6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZFP3Q96NJ6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZFP3Q96NJ6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZFP3Q96NJ6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZFP3Q96NJ6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZFP3Q96NJ6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZFP3Q96NJ6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZFP3Q96NJ6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZFP3Q96NJ6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZFP3Q96NJ6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZFP3Q96NJ6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZFP3Q96NJ6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZFP3Q96NJ6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZFP3Q96NJ6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZFP3Q96NJ6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZFP3Q96NJ6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZFP3Q96NJ6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZFP3Q96NJ6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZFP3Q96NJ6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZFP3Q96NJ6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZFP3Q96NJ6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZFP3Q96NJ6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZFP3Q96NJ6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZFP3Q96NJ6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZFP3Q96NJ6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZFP3Q96NJ6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZFP3Q96NJ6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFP3Q96NJ6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFP3Q96NJ6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFP3Q96NJ6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFP3Q96NJ6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFP3Q96NJ6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFP3Q96NJ6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFP3Q96NJ6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZFP3Q96NJ6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZFP3Q96NJ6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZFP3Q96NJ6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFP3Q96NJ6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFP3Q96NJ6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFP3Q96NJ6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFP3Q96NJ6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFP3Q96NJ6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFP3Q96NJ6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFP3Q96NJ6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFP3Q96NJ6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFP3Q96NJ6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFP3Q96NJ6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFP3Q96NJ6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZFP3Q96NJ6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZFP3Q96NJ6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZFP3Q96NJ6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZFP3Q96NJ6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZFP3Q96NJ6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZFP3Q96NJ6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZFP3Q96NJ6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZFP3Q96NJ6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZFP3Q96NJ6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZFP3Q96NJ6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZFP3Q96NJ6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZFP3Q96NJ6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZFP3Q96NJ6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZFP3Q96NJ6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZFP3Q96NJ6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZFP3Q96NJ6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZFP3Q96NJ6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZFP3Q96NJ6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZFP3Q96NJ6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZFP3Q96NJ6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZFP3Q96NJ6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZFP3Q96NJ6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZFP3Q96NJ6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZFP3Q96NJ6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZFP3Q96NJ6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZFP3Q96NJ6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZFP3Q96NJ6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms