Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN2

NLRP4, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP4Q96MN2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRP4Q96MN2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRP4Q96MN2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRP4Q96MN2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRP4Q96MN2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRP4Q96MN2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRP4Q96MN2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRP4Q96MN2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRP4Q96MN2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRP4Q96MN2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NLRP4Q96MN2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NLRP4Q96MN2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NLRP4Q96MN2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NLRP4Q96MN2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NLRP4Q96MN2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NLRP4Q96MN2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NLRP4Q96MN2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NLRP4Q96MN2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NLRP4Q96MN2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NLRP4Q96MN2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NLRP4Q96MN2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NLRP4Q96MN2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NLRP4Q96MN2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NLRP4Q96MN2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NLRP4Q96MN2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NLRP4Q96MN2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NLRP4Q96MN2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NLRP4Q96MN2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NLRP4Q96MN2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NLRP4Q96MN2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NLRP4Q96MN2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NLRP4Q96MN2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NLRP4Q96MN2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NLRP4Q96MN2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NLRP4Q96MN2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NLRP4Q96MN2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NLRP4Q96MN2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NLRP4Q96MN2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NLRP4Q96MN2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NLRP4Q96MN2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NLRP4Q96MN2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NLRP4Q96MN2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NLRP4Q96MN2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NLRP4Q96MN2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NLRP4Q96MN2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NLRP4Q96MN2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NLRP4Q96MN2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NLRP4Q96MN2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP4Q96MN2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP4Q96MN2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP4Q96MN2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP4Q96MN2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP4Q96MN2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP4Q96MN2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP4Q96MN2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP4Q96MN2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP4Q96MN2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP4Q96MN2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP4Q96MN2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP4Q96MN2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP4Q96MN2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP4Q96MN2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP4Q96MN2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP4Q96MN2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP4Q96MN2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRP4Q96MN2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRP4Q96MN2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRP4Q96MN2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRP4Q96MN2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRP4Q96MN2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRP4Q96MN2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP4Q96MN2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP4Q96MN2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP4Q96MN2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP4Q96MN2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP4Q96MN2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP4Q96MN2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP4Q96MN2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP4Q96MN2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRP4Q96MN2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRP4Q96MN2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRP4Q96MN2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRP4Q96MN2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRP4Q96MN2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRP4Q96MN2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRP4Q96MN2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRP4Q96MN2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRP4Q96MN2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NLRP4Q96MN2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NLRP4Q96MN2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NLRP4Q96MN2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NLRP4Q96MN2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NLRP4Q96MN2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NLRP4Q96MN2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NLRP4Q96MN2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NLRP4Q96MN2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NLRP4Q96MN2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NLRP4Q96MN2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRP4Q96MN2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRP4Q96MN2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms