Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF0

Putative uncharacterized protein LOC100506887, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q96MF0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q96MF0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q96MF0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q96MF0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q96MF0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q96MF0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Q96MF0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q96MF0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q96MF0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q96MF0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q96MF0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q96MF0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q96MF0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q96MF0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q96MF0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Q96MF0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q96MF0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q96MF0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q96MF0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q96MF0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q96MF0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q96MF0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q96MF0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q96MF0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q96MF0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q96MF0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q96MF0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q96MF0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q96MF0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q96MF0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q96MF0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Q96MF0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q96MF0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q96MF0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q96MF0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q96MF0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q96MF0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q96MF0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q96MF0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q96MF0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q96MF0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q96MF0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q96MF0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q96MF0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Q96MF0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q96MF0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q96MF0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q96MF0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q96MF0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q96MF0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q96MF0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Q96MF0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q96MF0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q96MF0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q96MF0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q96MF0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q96MF0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q96MF0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q96MF0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q96MF0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q96MF0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q96MF0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q96MF0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q96MF0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q96MF0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q96MF0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q96MF0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q96MF0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q96MF0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q96MF0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q96MF0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q96MF0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q96MF0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q96MF0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q96MF0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q96MF0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q96MF0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q96MF0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q96MF0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q96MF0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q96MF0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q96MF0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q96MF0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q96MF0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q96MF0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q96MF0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q96MF0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q96MF0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q96MF0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q96MF0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Q96MF0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Q96MF0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q96MF0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q96MF0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q96MF0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q96MF0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q96MF0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q96MF0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Q96MF0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Q96MF0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms