Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FAM227BQ96M60 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FAM227BQ96M60 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
FAM227BQ96M60 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FAM227BQ96M60 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
FAM227BQ96M60 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FAM227BQ96M60 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FAM227BQ96M60 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FAM227BQ96M60 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FAM227BQ96M60 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FAM227BQ96M60 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FAM227BQ96M60 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FAM227BQ96M60 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FAM227BQ96M60 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
FAM227BQ96M60 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FAM227BQ96M60 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
FAM227BQ96M60 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
FAM227BQ96M60 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
FAM227BQ96M60 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
FAM227BQ96M60 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
FAM227BQ96M60 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
FAM227BQ96M60 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
FAM227BQ96M60 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FAM227BQ96M60 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FAM227BQ96M60 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
FAM227BQ96M60 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FAM227BQ96M60 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FAM227BQ96M60 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FAM227BQ96M60 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FAM227BQ96M60 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
FAM227BQ96M60 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
FAM227BQ96M60 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
FAM227BQ96M60 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
FAM227BQ96M60 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
FAM227BQ96M60 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
FAM227BQ96M60 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
FAM227BQ96M60 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
FAM227BQ96M60 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
FAM227BQ96M60 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
FAM227BQ96M60 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FAM227BQ96M60 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FAM227BQ96M60 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FAM227BQ96M60 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FAM227BQ96M60 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FAM227BQ96M60 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FAM227BQ96M60 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FAM227BQ96M60 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
FAM227BQ96M60 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FAM227BQ96M60 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FAM227BQ96M60 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FAM227BQ96M60 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FAM227BQ96M60 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
FAM227BQ96M60 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FAM227BQ96M60 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FAM227BQ96M60 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
FAM227BQ96M60 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
FAM227BQ96M60 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
FAM227BQ96M60 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
FAM227BQ96M60 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
FAM227BQ96M60 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
FAM227BQ96M60 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
FAM227BQ96M60 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
FAM227BQ96M60 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FAM227BQ96M60 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
FAM227BQ96M60 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
FAM227BQ96M60 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
FAM227BQ96M60 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FAM227BQ96M60 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
FAM227BQ96M60 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FAM227BQ96M60 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
FAM227BQ96M60 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FAM227BQ96M60 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FAM227BQ96M60 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
FAM227BQ96M60 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FAM227BQ96M60 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FAM227BQ96M60 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FAM227BQ96M60 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
FAM227BQ96M60 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
FAM227BQ96M60 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FAM227BQ96M60 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
FAM227BQ96M60 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
FAM227BQ96M60 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
FAM227BQ96M60 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
FAM227BQ96M60 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
FAM227BQ96M60 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FAM227BQ96M60 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
FAM227BQ96M60 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
FAM227BQ96M60 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
FAM227BQ96M60 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
FAM227BQ96M60 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
FAM227BQ96M60 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
FAM227BQ96M60 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
FAM227BQ96M60 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
FAM227BQ96M60 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
FAM227BQ96M60 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
FAM227BQ96M60 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FAM227BQ96M60 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FAM227BQ96M60 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FAM227BQ96M60 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
FAM227BQ96M60 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms