Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPZA3Q96KX2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPZA3Q96KX2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPZA3Q96KX2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPZA3Q96KX2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPZA3Q96KX2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPZA3Q96KX2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPZA3Q96KX2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPZA3Q96KX2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPZA3Q96KX2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPZA3Q96KX2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPZA3Q96KX2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPZA3Q96KX2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPZA3Q96KX2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPZA3Q96KX2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPZA3Q96KX2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPZA3Q96KX2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPZA3Q96KX2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPZA3Q96KX2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPZA3Q96KX2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPZA3Q96KX2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPZA3Q96KX2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPZA3Q96KX2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPZA3Q96KX2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPZA3Q96KX2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPZA3Q96KX2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPZA3Q96KX2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPZA3Q96KX2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPZA3Q96KX2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPZA3Q96KX2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPZA3Q96KX2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAPZA3Q96KX2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CAPZA3Q96KX2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CAPZA3Q96KX2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPZA3Q96KX2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPZA3Q96KX2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPZA3Q96KX2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPZA3Q96KX2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPZA3Q96KX2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPZA3Q96KX2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPZA3Q96KX2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPZA3Q96KX2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPZA3Q96KX2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPZA3Q96KX2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPZA3Q96KX2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPZA3Q96KX2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPZA3Q96KX2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPZA3Q96KX2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPZA3Q96KX2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPZA3Q96KX2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPZA3Q96KX2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPZA3Q96KX2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPZA3Q96KX2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPZA3Q96KX2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPZA3Q96KX2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPZA3Q96KX2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPZA3Q96KX2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPZA3Q96KX2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPZA3Q96KX2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPZA3Q96KX2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CAPZA3Q96KX2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPZA3Q96KX2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPZA3Q96KX2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPZA3Q96KX2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPZA3Q96KX2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPZA3Q96KX2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPZA3Q96KX2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPZA3Q96KX2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPZA3Q96KX2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPZA3Q96KX2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPZA3Q96KX2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPZA3Q96KX2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPZA3Q96KX2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPZA3Q96KX2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPZA3Q96KX2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPZA3Q96KX2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPZA3Q96KX2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPZA3Q96KX2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CAPZA3Q96KX2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CAPZA3Q96KX2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CAPZA3Q96KX2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CAPZA3Q96KX2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CAPZA3Q96KX2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPZA3Q96KX2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPZA3Q96KX2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPZA3Q96KX2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPZA3Q96KX2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPZA3Q96KX2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPZA3Q96KX2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPZA3Q96KX2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPZA3Q96KX2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPZA3Q96KX2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPZA3Q96KX2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPZA3Q96KX2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPZA3Q96KX2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPZA3Q96KX2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPZA3Q96KX2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPZA3Q96KX2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPZA3Q96KX2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPZA3Q96KX2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms