Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ7

TMX3, Protein disulfide-isomerase TMX3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3Q96JJ7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMX3Q96JJ7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMX3Q96JJ7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMX3Q96JJ7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMX3Q96JJ7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMX3Q96JJ7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMX3Q96JJ7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMX3Q96JJ7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMX3Q96JJ7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMX3Q96JJ7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMX3Q96JJ7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TMX3Q96JJ7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TMX3Q96JJ7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TMX3Q96JJ7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TMX3Q96JJ7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMX3Q96JJ7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMX3Q96JJ7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMX3Q96JJ7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMX3Q96JJ7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMX3Q96JJ7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMX3Q96JJ7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMX3Q96JJ7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMX3Q96JJ7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMX3Q96JJ7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMX3Q96JJ7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMX3Q96JJ7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMX3Q96JJ7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMX3Q96JJ7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMX3Q96JJ7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMX3Q96JJ7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMX3Q96JJ7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMX3Q96JJ7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMX3Q96JJ7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMX3Q96JJ7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMX3Q96JJ7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMX3Q96JJ7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMX3Q96JJ7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMX3Q96JJ7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMX3Q96JJ7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TMX3Q96JJ7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TMX3Q96JJ7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMX3Q96JJ7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMX3Q96JJ7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMX3Q96JJ7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMX3Q96JJ7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMX3Q96JJ7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMX3Q96JJ7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMX3Q96JJ7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMX3Q96JJ7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMX3Q96JJ7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMX3Q96JJ7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMX3Q96JJ7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMX3Q96JJ7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMX3Q96JJ7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMX3Q96JJ7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMX3Q96JJ7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMX3Q96JJ7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMX3Q96JJ7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMX3Q96JJ7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMX3Q96JJ7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMX3Q96JJ7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMX3Q96JJ7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMX3Q96JJ7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMX3Q96JJ7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMX3Q96JJ7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMX3Q96JJ7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMX3Q96JJ7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TMX3Q96JJ7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TMX3Q96JJ7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TMX3Q96JJ7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMX3Q96JJ7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMX3Q96JJ7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMX3Q96JJ7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMX3Q96JJ7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMX3Q96JJ7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMX3Q96JJ7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMX3Q96JJ7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMX3Q96JJ7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMX3Q96JJ7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMX3Q96JJ7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMX3Q96JJ7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMX3Q96JJ7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMX3Q96JJ7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMX3Q96JJ7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMX3Q96JJ7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMX3Q96JJ7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMX3Q96JJ7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMX3Q96JJ7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
TMX3Q96JJ7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TMX3Q96JJ7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TMX3Q96JJ7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TMX3Q96JJ7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMX3Q96JJ7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMX3Q96JJ7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TMX3Q96JJ7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMX3Q96JJ7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMX3Q96JJ7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMX3Q96JJ7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMX3Q96JJ7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMX3Q96JJ7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms