Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CELF6Q96J87 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CELF6Q96J87 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CELF6Q96J87 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CELF6Q96J87 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CELF6Q96J87 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CELF6Q96J87 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CELF6Q96J87 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CELF6Q96J87 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CELF6Q96J87 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CELF6Q96J87 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CELF6Q96J87 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CELF6Q96J87 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CELF6Q96J87 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CELF6Q96J87 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CELF6Q96J87 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CELF6Q96J87 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CELF6Q96J87 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CELF6Q96J87 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CELF6Q96J87 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CELF6Q96J87 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CELF6Q96J87 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CELF6Q96J87 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CELF6Q96J87 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CELF6Q96J87 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CELF6Q96J87 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CELF6Q96J87 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CELF6Q96J87 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CELF6Q96J87 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CELF6Q96J87 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CELF6Q96J87 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CELF6Q96J87 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CELF6Q96J87 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CELF6Q96J87 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CELF6Q96J87 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CELF6Q96J87 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CELF6Q96J87 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CELF6Q96J87 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CELF6Q96J87 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CELF6Q96J87 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CELF6Q96J87 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CELF6Q96J87 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CELF6Q96J87 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CELF6Q96J87 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CELF6Q96J87 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CELF6Q96J87 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CELF6Q96J87 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CELF6Q96J87 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CELF6Q96J87 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CELF6Q96J87 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CELF6Q96J87 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CELF6Q96J87 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CELF6Q96J87 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CELF6Q96J87 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CELF6Q96J87 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CELF6Q96J87 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CELF6Q96J87 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CELF6Q96J87 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CELF6Q96J87 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CELF6Q96J87 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CELF6Q96J87 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CELF6Q96J87 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CELF6Q96J87 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CELF6Q96J87 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CELF6Q96J87 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CELF6Q96J87 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CELF6Q96J87 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CELF6Q96J87 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CELF6Q96J87 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CELF6Q96J87 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CELF6Q96J87 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CELF6Q96J87 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CELF6Q96J87 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CELF6Q96J87 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CELF6Q96J87 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CELF6Q96J87 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CELF6Q96J87 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CELF6Q96J87 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CELF6Q96J87 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CELF6Q96J87 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CELF6Q96J87 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CELF6Q96J87 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CELF6Q96J87 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CELF6Q96J87 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CELF6Q96J87 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CELF6Q96J87 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CELF6Q96J87 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CELF6Q96J87 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CELF6Q96J87 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CELF6Q96J87 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CELF6Q96J87 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CELF6Q96J87 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CELF6Q96J87 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CELF6Q96J87 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CELF6Q96J87 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CELF6Q96J87 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CELF6Q96J87 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CELF6Q96J87 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CELF6Q96J87 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CELF6Q96J87 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms