Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ABCC12Q96J65 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
ABCC12Q96J65 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ABCC12Q96J65 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ABCC12Q96J65 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
ABCC12Q96J65 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
ABCC12Q96J65 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
ABCC12Q96J65 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
ABCC12Q96J65 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
ABCC12Q96J65 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
ABCC12Q96J65 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
ABCC12Q96J65 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
ABCC12Q96J65 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
ABCC12Q96J65 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
ABCC12Q96J65 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ABCC12Q96J65 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ABCC12Q96J65 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ABCC12Q96J65 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ABCC12Q96J65 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ABCC12Q96J65 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
ABCC12Q96J65 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
ABCC12Q96J65 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
ABCC12Q96J65 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
ABCC12Q96J65 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
ABCC12Q96J65 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ABCC12Q96J65 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
ABCC12Q96J65 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
ABCC12Q96J65 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
ABCC12Q96J65 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ABCC12Q96J65 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ABCC12Q96J65 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ABCC12Q96J65 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ABCC12Q96J65 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ABCC12Q96J65 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ABCC12Q96J65 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ABCC12Q96J65 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ABCC12Q96J65 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
ABCC12Q96J65 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ABCC12Q96J65 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ABCC12Q96J65 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
ABCC12Q96J65 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ABCC12Q96J65 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
ABCC12Q96J65 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
ABCC12Q96J65 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC31.13■■■□□ 2.57
ABCC12Q96J65 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
ABCC12Q96J65 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
ABCC12Q96J65 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ABCC12Q96J65 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ABCC12Q96J65 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ABCC12Q96J65 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ABCC12Q96J65 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ABCC12Q96J65 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ABCC12Q96J65 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
ABCC12Q96J65 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ABCC12Q96J65 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ABCC12Q96J65 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ABCC12Q96J65 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ABCC12Q96J65 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ABCC12Q96J65 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ABCC12Q96J65 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ABCC12Q96J65 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ABCC12Q96J65 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ABCC12Q96J65 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
ABCC12Q96J65 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ABCC12Q96J65 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ABCC12Q96J65 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
ABCC12Q96J65 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
ABCC12Q96J65 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC31■■■□□ 2.55
ABCC12Q96J65 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC31■■■□□ 2.55
ABCC12Q96J65 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms