Protein–RNA interactions for Protein: Q96HB5

CCDC120, Coiled-coil domain-containing protein 120, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC120Q96HB5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC120Q96HB5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC120Q96HB5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC120Q96HB5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC120Q96HB5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC120Q96HB5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC120Q96HB5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC120Q96HB5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC120Q96HB5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC120Q96HB5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC120Q96HB5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC120Q96HB5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC120Q96HB5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC120Q96HB5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC120Q96HB5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC120Q96HB5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC120Q96HB5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC120Q96HB5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC120Q96HB5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC120Q96HB5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC120Q96HB5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC120Q96HB5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC120Q96HB5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC120Q96HB5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC120Q96HB5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC120Q96HB5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC120Q96HB5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC120Q96HB5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC120Q96HB5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC120Q96HB5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC120Q96HB5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC120Q96HB5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC120Q96HB5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC120Q96HB5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC120Q96HB5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC120Q96HB5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC120Q96HB5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC120Q96HB5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC120Q96HB5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC120Q96HB5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC120Q96HB5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC120Q96HB5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC120Q96HB5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC120Q96HB5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC120Q96HB5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC120Q96HB5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC120Q96HB5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC120Q96HB5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC120Q96HB5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC120Q96HB5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC120Q96HB5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC120Q96HB5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC120Q96HB5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC120Q96HB5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC120Q96HB5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC120Q96HB5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC120Q96HB5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC120Q96HB5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC120Q96HB5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC120Q96HB5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC120Q96HB5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC120Q96HB5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC120Q96HB5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC120Q96HB5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC120Q96HB5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC120Q96HB5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC120Q96HB5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC120Q96HB5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC120Q96HB5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC120Q96HB5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC120Q96HB5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC120Q96HB5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC120Q96HB5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC120Q96HB5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC120Q96HB5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC120Q96HB5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC120Q96HB5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC120Q96HB5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC120Q96HB5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC120Q96HB5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC120Q96HB5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC120Q96HB5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC120Q96HB5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC120Q96HB5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC120Q96HB5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC120Q96HB5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC120Q96HB5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC120Q96HB5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC120Q96HB5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC120Q96HB5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC120Q96HB5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC120Q96HB5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC120Q96HB5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC120Q96HB5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC120Q96HB5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC120Q96HB5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC120Q96HB5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC120Q96HB5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC120Q96HB5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC120Q96HB5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms