Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC35A4Q96G79 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC35A4Q96G79 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC35A4Q96G79 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC35A4Q96G79 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC35A4Q96G79 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC35A4Q96G79 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC35A4Q96G79 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC35A4Q96G79 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC35A4Q96G79 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC35A4Q96G79 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC35A4Q96G79 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC35A4Q96G79 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC35A4Q96G79 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC35A4Q96G79 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC35A4Q96G79 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC35A4Q96G79 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC35A4Q96G79 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC35A4Q96G79 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC35A4Q96G79 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC35A4Q96G79 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC35A4Q96G79 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC35A4Q96G79 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC35A4Q96G79 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC35A4Q96G79 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC35A4Q96G79 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC35A4Q96G79 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC35A4Q96G79 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC35A4Q96G79 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC35A4Q96G79 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC35A4Q96G79 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC35A4Q96G79 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC35A4Q96G79 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC35A4Q96G79 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC35A4Q96G79 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC35A4Q96G79 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC35A4Q96G79 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC35A4Q96G79 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC35A4Q96G79 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC35A4Q96G79 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC35A4Q96G79 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC35A4Q96G79 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC35A4Q96G79 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC35A4Q96G79 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC35A4Q96G79 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC35A4Q96G79 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC35A4Q96G79 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC35A4Q96G79 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC35A4Q96G79 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC35A4Q96G79 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC35A4Q96G79 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC35A4Q96G79 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC35A4Q96G79 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC35A4Q96G79 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC35A4Q96G79 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC35A4Q96G79 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC35A4Q96G79 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC35A4Q96G79 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC35A4Q96G79 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC35A4Q96G79 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC35A4Q96G79 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC35A4Q96G79 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC35A4Q96G79 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC35A4Q96G79 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC35A4Q96G79 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC35A4Q96G79 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC35A4Q96G79 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC35A4Q96G79 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC35A4Q96G79 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC35A4Q96G79 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC35A4Q96G79 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC35A4Q96G79 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC35A4Q96G79 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC35A4Q96G79 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC35A4Q96G79 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC35A4Q96G79 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC35A4Q96G79 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC35A4Q96G79 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC35A4Q96G79 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC35A4Q96G79 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC35A4Q96G79 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC35A4Q96G79 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC35A4Q96G79 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC35A4Q96G79 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC35A4Q96G79 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC35A4Q96G79 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC35A4Q96G79 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC35A4Q96G79 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC35A4Q96G79 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC35A4Q96G79 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC35A4Q96G79 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC35A4Q96G79 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC35A4Q96G79 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC35A4Q96G79 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC35A4Q96G79 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC35A4Q96G79 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC35A4Q96G79 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC35A4Q96G79 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC35A4Q96G79 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC35A4Q96G79 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms