Protein–RNA interactions for Protein: Q96E40

SPACA9, Sperm acrosome-associated protein 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA9Q96E40 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPACA9Q96E40 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPACA9Q96E40 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPACA9Q96E40 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPACA9Q96E40 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPACA9Q96E40 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPACA9Q96E40 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPACA9Q96E40 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPACA9Q96E40 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPACA9Q96E40 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPACA9Q96E40 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPACA9Q96E40 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPACA9Q96E40 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPACA9Q96E40 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPACA9Q96E40 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPACA9Q96E40 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPACA9Q96E40 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPACA9Q96E40 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPACA9Q96E40 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SPACA9Q96E40 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPACA9Q96E40 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPACA9Q96E40 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPACA9Q96E40 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPACA9Q96E40 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPACA9Q96E40 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPACA9Q96E40 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPACA9Q96E40 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPACA9Q96E40 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPACA9Q96E40 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPACA9Q96E40 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPACA9Q96E40 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPACA9Q96E40 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPACA9Q96E40 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPACA9Q96E40 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPACA9Q96E40 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPACA9Q96E40 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPACA9Q96E40 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPACA9Q96E40 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPACA9Q96E40 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPACA9Q96E40 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPACA9Q96E40 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPACA9Q96E40 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
SPACA9Q96E40 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPACA9Q96E40 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPACA9Q96E40 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SPACA9Q96E40 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPACA9Q96E40 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPACA9Q96E40 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPACA9Q96E40 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SPACA9Q96E40 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPACA9Q96E40 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPACA9Q96E40 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPACA9Q96E40 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPACA9Q96E40 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPACA9Q96E40 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPACA9Q96E40 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SPACA9Q96E40 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPACA9Q96E40 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPACA9Q96E40 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SPACA9Q96E40 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPACA9Q96E40 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPACA9Q96E40 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPACA9Q96E40 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPACA9Q96E40 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPACA9Q96E40 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPACA9Q96E40 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPACA9Q96E40 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPACA9Q96E40 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPACA9Q96E40 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPACA9Q96E40 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPACA9Q96E40 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPACA9Q96E40 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPACA9Q96E40 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPACA9Q96E40 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPACA9Q96E40 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPACA9Q96E40 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPACA9Q96E40 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPACA9Q96E40 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPACA9Q96E40 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPACA9Q96E40 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPACA9Q96E40 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPACA9Q96E40 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPACA9Q96E40 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPACA9Q96E40 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPACA9Q96E40 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPACA9Q96E40 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPACA9Q96E40 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPACA9Q96E40 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SPACA9Q96E40 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SPACA9Q96E40 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPACA9Q96E40 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPACA9Q96E40 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPACA9Q96E40 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPACA9Q96E40 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPACA9Q96E40 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPACA9Q96E40 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPACA9Q96E40 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPACA9Q96E40 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPACA9Q96E40 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPACA9Q96E40 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms