Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC39Q96DD0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms