Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPTSSAQ969W0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPTSSAQ969W0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPTSSAQ969W0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPTSSAQ969W0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPTSSAQ969W0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPTSSAQ969W0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPTSSAQ969W0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPTSSAQ969W0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SPTSSAQ969W0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPTSSAQ969W0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPTSSAQ969W0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPTSSAQ969W0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPTSSAQ969W0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPTSSAQ969W0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPTSSAQ969W0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPTSSAQ969W0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPTSSAQ969W0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPTSSAQ969W0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPTSSAQ969W0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPTSSAQ969W0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPTSSAQ969W0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SPTSSAQ969W0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPTSSAQ969W0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPTSSAQ969W0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPTSSAQ969W0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPTSSAQ969W0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SPTSSAQ969W0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPTSSAQ969W0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPTSSAQ969W0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPTSSAQ969W0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPTSSAQ969W0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPTSSAQ969W0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPTSSAQ969W0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPTSSAQ969W0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPTSSAQ969W0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPTSSAQ969W0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPTSSAQ969W0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPTSSAQ969W0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPTSSAQ969W0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPTSSAQ969W0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPTSSAQ969W0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPTSSAQ969W0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPTSSAQ969W0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPTSSAQ969W0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPTSSAQ969W0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SPTSSAQ969W0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SPTSSAQ969W0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPTSSAQ969W0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPTSSAQ969W0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPTSSAQ969W0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SPTSSAQ969W0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPTSSAQ969W0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPTSSAQ969W0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPTSSAQ969W0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPTSSAQ969W0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPTSSAQ969W0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPTSSAQ969W0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPTSSAQ969W0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPTSSAQ969W0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPTSSAQ969W0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPTSSAQ969W0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPTSSAQ969W0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPTSSAQ969W0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPTSSAQ969W0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTSSAQ969W0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTSSAQ969W0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTSSAQ969W0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTSSAQ969W0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTSSAQ969W0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTSSAQ969W0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPTSSAQ969W0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPTSSAQ969W0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPTSSAQ969W0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPTSSAQ969W0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPTSSAQ969W0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPTSSAQ969W0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPTSSAQ969W0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPTSSAQ969W0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SPTSSAQ969W0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SPTSSAQ969W0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPTSSAQ969W0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPTSSAQ969W0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPTSSAQ969W0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPTSSAQ969W0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPTSSAQ969W0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPTSSAQ969W0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SPTSSAQ969W0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPTSSAQ969W0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPTSSAQ969W0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPTSSAQ969W0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPTSSAQ969W0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPTSSAQ969W0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPTSSAQ969W0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPTSSAQ969W0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPTSSAQ969W0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPTSSAQ969W0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPTSSAQ969W0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SPTSSAQ969W0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPTSSAQ969W0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms