Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEIL2Q969S2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEIL2Q969S2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEIL2Q969S2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEIL2Q969S2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEIL2Q969S2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEIL2Q969S2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEIL2Q969S2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEIL2Q969S2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEIL2Q969S2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEIL2Q969S2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEIL2Q969S2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEIL2Q969S2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEIL2Q969S2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEIL2Q969S2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEIL2Q969S2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEIL2Q969S2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEIL2Q969S2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEIL2Q969S2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEIL2Q969S2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEIL2Q969S2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEIL2Q969S2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEIL2Q969S2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEIL2Q969S2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEIL2Q969S2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEIL2Q969S2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEIL2Q969S2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NEIL2Q969S2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEIL2Q969S2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEIL2Q969S2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEIL2Q969S2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEIL2Q969S2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEIL2Q969S2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEIL2Q969S2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NEIL2Q969S2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEIL2Q969S2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEIL2Q969S2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEIL2Q969S2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEIL2Q969S2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEIL2Q969S2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEIL2Q969S2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEIL2Q969S2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEIL2Q969S2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEIL2Q969S2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEIL2Q969S2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEIL2Q969S2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEIL2Q969S2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEIL2Q969S2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEIL2Q969S2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEIL2Q969S2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEIL2Q969S2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEIL2Q969S2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEIL2Q969S2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEIL2Q969S2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEIL2Q969S2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEIL2Q969S2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEIL2Q969S2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEIL2Q969S2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEIL2Q969S2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NEIL2Q969S2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NEIL2Q969S2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEIL2Q969S2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEIL2Q969S2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NEIL2Q969S2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEIL2Q969S2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEIL2Q969S2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEIL2Q969S2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEIL2Q969S2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEIL2Q969S2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEIL2Q969S2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEIL2Q969S2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEIL2Q969S2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEIL2Q969S2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEIL2Q969S2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEIL2Q969S2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEIL2Q969S2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEIL2Q969S2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEIL2Q969S2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEIL2Q969S2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEIL2Q969S2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NEIL2Q969S2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEIL2Q969S2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEIL2Q969S2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEIL2Q969S2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEIL2Q969S2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEIL2Q969S2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEIL2Q969S2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEIL2Q969S2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEIL2Q969S2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEIL2Q969S2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEIL2Q969S2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEIL2Q969S2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEIL2Q969S2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEIL2Q969S2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEIL2Q969S2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEIL2Q969S2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEIL2Q969S2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEIL2Q969S2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEIL2Q969S2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEIL2Q969S2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms