Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWK9

CKAP2, Cytoskeleton-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2Q8WWK9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CKAP2Q8WWK9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CKAP2Q8WWK9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CKAP2Q8WWK9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CKAP2Q8WWK9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CKAP2Q8WWK9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKAP2Q8WWK9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKAP2Q8WWK9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKAP2Q8WWK9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKAP2Q8WWK9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CKAP2Q8WWK9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CKAP2Q8WWK9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CKAP2Q8WWK9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CKAP2Q8WWK9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CKAP2Q8WWK9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CKAP2Q8WWK9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CKAP2Q8WWK9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CKAP2Q8WWK9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CKAP2Q8WWK9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CKAP2Q8WWK9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKAP2Q8WWK9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKAP2Q8WWK9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CKAP2Q8WWK9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKAP2Q8WWK9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKAP2Q8WWK9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKAP2Q8WWK9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKAP2Q8WWK9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CKAP2Q8WWK9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CKAP2Q8WWK9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CKAP2Q8WWK9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CKAP2Q8WWK9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKAP2Q8WWK9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKAP2Q8WWK9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKAP2Q8WWK9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKAP2Q8WWK9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKAP2Q8WWK9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKAP2Q8WWK9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CKAP2Q8WWK9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CKAP2Q8WWK9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CKAP2Q8WWK9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CKAP2Q8WWK9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CKAP2Q8WWK9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CKAP2Q8WWK9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CKAP2Q8WWK9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CKAP2Q8WWK9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CKAP2Q8WWK9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CKAP2Q8WWK9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CKAP2Q8WWK9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CKAP2Q8WWK9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CKAP2Q8WWK9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CKAP2Q8WWK9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CKAP2Q8WWK9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CKAP2Q8WWK9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CKAP2Q8WWK9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CKAP2Q8WWK9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CKAP2Q8WWK9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CKAP2Q8WWK9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CKAP2Q8WWK9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CKAP2Q8WWK9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CKAP2Q8WWK9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CKAP2Q8WWK9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CKAP2Q8WWK9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CKAP2Q8WWK9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CKAP2Q8WWK9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CKAP2Q8WWK9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CKAP2Q8WWK9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CKAP2Q8WWK9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CKAP2Q8WWK9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CKAP2Q8WWK9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CKAP2Q8WWK9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CKAP2Q8WWK9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CKAP2Q8WWK9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CKAP2Q8WWK9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CKAP2Q8WWK9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CKAP2Q8WWK9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CKAP2Q8WWK9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CKAP2Q8WWK9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CKAP2Q8WWK9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CKAP2Q8WWK9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CKAP2Q8WWK9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CKAP2Q8WWK9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CKAP2Q8WWK9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CKAP2Q8WWK9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CKAP2Q8WWK9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CKAP2Q8WWK9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CKAP2Q8WWK9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CKAP2Q8WWK9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CKAP2Q8WWK9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CKAP2Q8WWK9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CKAP2Q8WWK9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CKAP2Q8WWK9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CKAP2Q8WWK9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CKAP2Q8WWK9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CKAP2Q8WWK9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CKAP2Q8WWK9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CKAP2Q8WWK9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CKAP2Q8WWK9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CKAP2Q8WWK9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CKAP2Q8WWK9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CKAP2Q8WWK9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms