Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DCAF4Q8WV16 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DCAF4Q8WV16 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DCAF4Q8WV16 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DCAF4Q8WV16 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DCAF4Q8WV16 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DCAF4Q8WV16 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DCAF4Q8WV16 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DCAF4Q8WV16 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DCAF4Q8WV16 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DCAF4Q8WV16 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DCAF4Q8WV16 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DCAF4Q8WV16 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DCAF4Q8WV16 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DCAF4Q8WV16 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DCAF4Q8WV16 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DCAF4Q8WV16 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DCAF4Q8WV16 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DCAF4Q8WV16 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DCAF4Q8WV16 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DCAF4Q8WV16 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DCAF4Q8WV16 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DCAF4Q8WV16 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DCAF4Q8WV16 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DCAF4Q8WV16 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DCAF4Q8WV16 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
DCAF4Q8WV16 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DCAF4Q8WV16 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DCAF4Q8WV16 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
DCAF4Q8WV16 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
DCAF4Q8WV16 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DCAF4Q8WV16 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DCAF4Q8WV16 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DCAF4Q8WV16 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DCAF4Q8WV16 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DCAF4Q8WV16 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DCAF4Q8WV16 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DCAF4Q8WV16 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
DCAF4Q8WV16 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
DCAF4Q8WV16 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DCAF4Q8WV16 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DCAF4Q8WV16 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DCAF4Q8WV16 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
DCAF4Q8WV16 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
DCAF4Q8WV16 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DCAF4Q8WV16 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DCAF4Q8WV16 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DCAF4Q8WV16 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DCAF4Q8WV16 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
DCAF4Q8WV16 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
DCAF4Q8WV16 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DCAF4Q8WV16 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DCAF4Q8WV16 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DCAF4Q8WV16 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DCAF4Q8WV16 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DCAF4Q8WV16 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DCAF4Q8WV16 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
DCAF4Q8WV16 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DCAF4Q8WV16 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DCAF4Q8WV16 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
DCAF4Q8WV16 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
DCAF4Q8WV16 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DCAF4Q8WV16 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DCAF4Q8WV16 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
DCAF4Q8WV16 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
DCAF4Q8WV16 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DCAF4Q8WV16 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DCAF4Q8WV16 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DCAF4Q8WV16 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DCAF4Q8WV16 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DCAF4Q8WV16 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
DCAF4Q8WV16 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DCAF4Q8WV16 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DCAF4Q8WV16 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DCAF4Q8WV16 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DCAF4Q8WV16 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DCAF4Q8WV16 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DCAF4Q8WV16 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DCAF4Q8WV16 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DCAF4Q8WV16 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DCAF4Q8WV16 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
DCAF4Q8WV16 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DCAF4Q8WV16 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DCAF4Q8WV16 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DCAF4Q8WV16 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
DCAF4Q8WV16 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DCAF4Q8WV16 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DCAF4Q8WV16 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DCAF4Q8WV16 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DCAF4Q8WV16 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DCAF4Q8WV16 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DCAF4Q8WV16 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DCAF4Q8WV16 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
DCAF4Q8WV16 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DCAF4Q8WV16 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DCAF4Q8WV16 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
DCAF4Q8WV16 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
DCAF4Q8WV16 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
DCAF4Q8WV16 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
DCAF4Q8WV16 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms