Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU2

SSC4D, Scavenger receptor cysteine-rich domain-containing group B protein, humanhuman

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Length 575 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC4DQ8WTU2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSC4DQ8WTU2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSC4DQ8WTU2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSC4DQ8WTU2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSC4DQ8WTU2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSC4DQ8WTU2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSC4DQ8WTU2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSC4DQ8WTU2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSC4DQ8WTU2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SSC4DQ8WTU2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSC4DQ8WTU2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSC4DQ8WTU2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSC4DQ8WTU2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSC4DQ8WTU2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSC4DQ8WTU2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSC4DQ8WTU2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSC4DQ8WTU2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSC4DQ8WTU2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSC4DQ8WTU2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SSC4DQ8WTU2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSC4DQ8WTU2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SSC4DQ8WTU2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSC4DQ8WTU2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSC4DQ8WTU2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSC4DQ8WTU2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SSC4DQ8WTU2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SSC4DQ8WTU2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSC4DQ8WTU2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSC4DQ8WTU2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSC4DQ8WTU2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSC4DQ8WTU2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSC4DQ8WTU2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSC4DQ8WTU2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SSC4DQ8WTU2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SSC4DQ8WTU2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSC4DQ8WTU2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSC4DQ8WTU2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSC4DQ8WTU2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSC4DQ8WTU2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSC4DQ8WTU2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSC4DQ8WTU2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSC4DQ8WTU2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSC4DQ8WTU2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSC4DQ8WTU2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSC4DQ8WTU2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSC4DQ8WTU2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSC4DQ8WTU2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSC4DQ8WTU2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSC4DQ8WTU2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSC4DQ8WTU2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SSC4DQ8WTU2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSC4DQ8WTU2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSC4DQ8WTU2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SSC4DQ8WTU2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SSC4DQ8WTU2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSC4DQ8WTU2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSC4DQ8WTU2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSC4DQ8WTU2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSC4DQ8WTU2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSC4DQ8WTU2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSC4DQ8WTU2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSC4DQ8WTU2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSC4DQ8WTU2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSC4DQ8WTU2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSC4DQ8WTU2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSC4DQ8WTU2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSC4DQ8WTU2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSC4DQ8WTU2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SSC4DQ8WTU2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSC4DQ8WTU2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSC4DQ8WTU2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SSC4DQ8WTU2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SSC4DQ8WTU2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSC4DQ8WTU2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSC4DQ8WTU2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSC4DQ8WTU2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSC4DQ8WTU2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSC4DQ8WTU2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSC4DQ8WTU2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSC4DQ8WTU2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSC4DQ8WTU2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSC4DQ8WTU2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSC4DQ8WTU2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSC4DQ8WTU2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSC4DQ8WTU2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSC4DQ8WTU2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSC4DQ8WTU2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSC4DQ8WTU2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSC4DQ8WTU2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSC4DQ8WTU2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSC4DQ8WTU2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSC4DQ8WTU2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSC4DQ8WTU2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SSC4DQ8WTU2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSC4DQ8WTU2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSC4DQ8WTU2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSC4DQ8WTU2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSC4DQ8WTU2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSC4DQ8WTU2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSC4DQ8WTU2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
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