Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HELQQ8TDG4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HELQQ8TDG4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HELQQ8TDG4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HELQQ8TDG4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
HELQQ8TDG4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HELQQ8TDG4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HELQQ8TDG4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HELQQ8TDG4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HELQQ8TDG4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HELQQ8TDG4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HELQQ8TDG4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HELQQ8TDG4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
HELQQ8TDG4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HELQQ8TDG4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HELQQ8TDG4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HELQQ8TDG4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HELQQ8TDG4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HELQQ8TDG4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HELQQ8TDG4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HELQQ8TDG4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HELQQ8TDG4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HELQQ8TDG4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HELQQ8TDG4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HELQQ8TDG4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HELQQ8TDG4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HELQQ8TDG4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HELQQ8TDG4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HELQQ8TDG4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HELQQ8TDG4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HELQQ8TDG4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HELQQ8TDG4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HELQQ8TDG4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HELQQ8TDG4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
HELQQ8TDG4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HELQQ8TDG4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HELQQ8TDG4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HELQQ8TDG4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HELQQ8TDG4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HELQQ8TDG4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HELQQ8TDG4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HELQQ8TDG4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HELQQ8TDG4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
HELQQ8TDG4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HELQQ8TDG4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HELQQ8TDG4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HELQQ8TDG4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HELQQ8TDG4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HELQQ8TDG4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HELQQ8TDG4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HELQQ8TDG4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HELQQ8TDG4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
HELQQ8TDG4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HELQQ8TDG4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HELQQ8TDG4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HELQQ8TDG4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HELQQ8TDG4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HELQQ8TDG4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
HELQQ8TDG4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HELQQ8TDG4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
HELQQ8TDG4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HELQQ8TDG4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
HELQQ8TDG4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HELQQ8TDG4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HELQQ8TDG4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HELQQ8TDG4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HELQQ8TDG4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HELQQ8TDG4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HELQQ8TDG4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HELQQ8TDG4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HELQQ8TDG4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HELQQ8TDG4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HELQQ8TDG4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HELQQ8TDG4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HELQQ8TDG4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HELQQ8TDG4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HELQQ8TDG4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HELQQ8TDG4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HELQQ8TDG4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HELQQ8TDG4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
HELQQ8TDG4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HELQQ8TDG4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HELQQ8TDG4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HELQQ8TDG4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HELQQ8TDG4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HELQQ8TDG4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HELQQ8TDG4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HELQQ8TDG4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HELQQ8TDG4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HELQQ8TDG4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HELQQ8TDG4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HELQQ8TDG4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HELQQ8TDG4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HELQQ8TDG4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
HELQQ8TDG4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HELQQ8TDG4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HELQQ8TDG4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HELQQ8TDG4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HELQQ8TDG4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
HELQQ8TDG4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms