Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF397Q8NF99 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNF397Q8NF99 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNF397Q8NF99 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNF397Q8NF99 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF397Q8NF99 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF397Q8NF99 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF397Q8NF99 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF397Q8NF99 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF397Q8NF99 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF397Q8NF99 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF397Q8NF99 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF397Q8NF99 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF397Q8NF99 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF397Q8NF99 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF397Q8NF99 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF397Q8NF99 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF397Q8NF99 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF397Q8NF99 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF397Q8NF99 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF397Q8NF99 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF397Q8NF99 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF397Q8NF99 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF397Q8NF99 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF397Q8NF99 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF397Q8NF99 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF397Q8NF99 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF397Q8NF99 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF397Q8NF99 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF397Q8NF99 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF397Q8NF99 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF397Q8NF99 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF397Q8NF99 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF397Q8NF99 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF397Q8NF99 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF397Q8NF99 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF397Q8NF99 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF397Q8NF99 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF397Q8NF99 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF397Q8NF99 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF397Q8NF99 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF397Q8NF99 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF397Q8NF99 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF397Q8NF99 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF397Q8NF99 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF397Q8NF99 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF397Q8NF99 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF397Q8NF99 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF397Q8NF99 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF397Q8NF99 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF397Q8NF99 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF397Q8NF99 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF397Q8NF99 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF397Q8NF99 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF397Q8NF99 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF397Q8NF99 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ZNF397Q8NF99 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF397Q8NF99 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF397Q8NF99 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF397Q8NF99 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF397Q8NF99 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF397Q8NF99 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF397Q8NF99 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF397Q8NF99 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF397Q8NF99 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF397Q8NF99 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF397Q8NF99 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF397Q8NF99 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF397Q8NF99 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF397Q8NF99 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF397Q8NF99 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF397Q8NF99 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF397Q8NF99 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF397Q8NF99 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF397Q8NF99 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF397Q8NF99 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF397Q8NF99 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF397Q8NF99 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF397Q8NF99 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF397Q8NF99 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF397Q8NF99 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF397Q8NF99 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF397Q8NF99 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF397Q8NF99 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF397Q8NF99 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF397Q8NF99 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF397Q8NF99 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZNF397Q8NF99 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZNF397Q8NF99 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZNF397Q8NF99 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZNF397Q8NF99 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZNF397Q8NF99 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZNF397Q8NF99 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF397Q8NF99 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF397Q8NF99 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF397Q8NF99 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF397Q8NF99 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF397Q8NF99 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF397Q8NF99 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF397Q8NF99 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms