Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND07

BBOF1, Basal body-orientation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOF1Q8ND07 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BBOF1Q8ND07 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BBOF1Q8ND07 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BBOF1Q8ND07 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BBOF1Q8ND07 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BBOF1Q8ND07 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BBOF1Q8ND07 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BBOF1Q8ND07 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BBOF1Q8ND07 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BBOF1Q8ND07 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BBOF1Q8ND07 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BBOF1Q8ND07 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BBOF1Q8ND07 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BBOF1Q8ND07 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BBOF1Q8ND07 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BBOF1Q8ND07 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BBOF1Q8ND07 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BBOF1Q8ND07 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BBOF1Q8ND07 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BBOF1Q8ND07 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BBOF1Q8ND07 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BBOF1Q8ND07 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BBOF1Q8ND07 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BBOF1Q8ND07 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BBOF1Q8ND07 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BBOF1Q8ND07 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BBOF1Q8ND07 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BBOF1Q8ND07 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BBOF1Q8ND07 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BBOF1Q8ND07 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BBOF1Q8ND07 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BBOF1Q8ND07 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BBOF1Q8ND07 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BBOF1Q8ND07 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BBOF1Q8ND07 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BBOF1Q8ND07 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BBOF1Q8ND07 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BBOF1Q8ND07 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BBOF1Q8ND07 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BBOF1Q8ND07 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BBOF1Q8ND07 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BBOF1Q8ND07 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BBOF1Q8ND07 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BBOF1Q8ND07 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BBOF1Q8ND07 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BBOF1Q8ND07 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BBOF1Q8ND07 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BBOF1Q8ND07 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BBOF1Q8ND07 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BBOF1Q8ND07 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BBOF1Q8ND07 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BBOF1Q8ND07 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BBOF1Q8ND07 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BBOF1Q8ND07 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BBOF1Q8ND07 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BBOF1Q8ND07 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BBOF1Q8ND07 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BBOF1Q8ND07 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BBOF1Q8ND07 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
BBOF1Q8ND07 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
BBOF1Q8ND07 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BBOF1Q8ND07 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BBOF1Q8ND07 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BBOF1Q8ND07 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BBOF1Q8ND07 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BBOF1Q8ND07 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BBOF1Q8ND07 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BBOF1Q8ND07 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BBOF1Q8ND07 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BBOF1Q8ND07 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BBOF1Q8ND07 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BBOF1Q8ND07 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BBOF1Q8ND07 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BBOF1Q8ND07 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BBOF1Q8ND07 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BBOF1Q8ND07 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BBOF1Q8ND07 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BBOF1Q8ND07 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BBOF1Q8ND07 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BBOF1Q8ND07 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BBOF1Q8ND07 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BBOF1Q8ND07 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BBOF1Q8ND07 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BBOF1Q8ND07 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BBOF1Q8ND07 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BBOF1Q8ND07 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BBOF1Q8ND07 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BBOF1Q8ND07 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
BBOF1Q8ND07 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BBOF1Q8ND07 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BBOF1Q8ND07 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BBOF1Q8ND07 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BBOF1Q8ND07 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BBOF1Q8ND07 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BBOF1Q8ND07 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BBOF1Q8ND07 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BBOF1Q8ND07 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BBOF1Q8ND07 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BBOF1Q8ND07 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
BBOF1Q8ND07 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.3 ms