Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA29

MFSD2A, Sodium-dependent lysophosphatidylcholine symporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD2AQ8NA29 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MFSD2AQ8NA29 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MFSD2AQ8NA29 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MFSD2AQ8NA29 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MFSD2AQ8NA29 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MFSD2AQ8NA29 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MFSD2AQ8NA29 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MFSD2AQ8NA29 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MFSD2AQ8NA29 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MFSD2AQ8NA29 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MFSD2AQ8NA29 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MFSD2AQ8NA29 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MFSD2AQ8NA29 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MFSD2AQ8NA29 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MFSD2AQ8NA29 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MFSD2AQ8NA29 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MFSD2AQ8NA29 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MFSD2AQ8NA29 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MFSD2AQ8NA29 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MFSD2AQ8NA29 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MFSD2AQ8NA29 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MFSD2AQ8NA29 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MFSD2AQ8NA29 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MFSD2AQ8NA29 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MFSD2AQ8NA29 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MFSD2AQ8NA29 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MFSD2AQ8NA29 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MFSD2AQ8NA29 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MFSD2AQ8NA29 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MFSD2AQ8NA29 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MFSD2AQ8NA29 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MFSD2AQ8NA29 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MFSD2AQ8NA29 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MFSD2AQ8NA29 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MFSD2AQ8NA29 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MFSD2AQ8NA29 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MFSD2AQ8NA29 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MFSD2AQ8NA29 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MFSD2AQ8NA29 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MFSD2AQ8NA29 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MFSD2AQ8NA29 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MFSD2AQ8NA29 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MFSD2AQ8NA29 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MFSD2AQ8NA29 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MFSD2AQ8NA29 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MFSD2AQ8NA29 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MFSD2AQ8NA29 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MFSD2AQ8NA29 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MFSD2AQ8NA29 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MFSD2AQ8NA29 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MFSD2AQ8NA29 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MFSD2AQ8NA29 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MFSD2AQ8NA29 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MFSD2AQ8NA29 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MFSD2AQ8NA29 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MFSD2AQ8NA29 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MFSD2AQ8NA29 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MFSD2AQ8NA29 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MFSD2AQ8NA29 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MFSD2AQ8NA29 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MFSD2AQ8NA29 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MFSD2AQ8NA29 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MFSD2AQ8NA29 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MFSD2AQ8NA29 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MFSD2AQ8NA29 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MFSD2AQ8NA29 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MFSD2AQ8NA29 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MFSD2AQ8NA29 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MFSD2AQ8NA29 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MFSD2AQ8NA29 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MFSD2AQ8NA29 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MFSD2AQ8NA29 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MFSD2AQ8NA29 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MFSD2AQ8NA29 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MFSD2AQ8NA29 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MFSD2AQ8NA29 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MFSD2AQ8NA29 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MFSD2AQ8NA29 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MFSD2AQ8NA29 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MFSD2AQ8NA29 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MFSD2AQ8NA29 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MFSD2AQ8NA29 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MFSD2AQ8NA29 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MFSD2AQ8NA29 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MFSD2AQ8NA29 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MFSD2AQ8NA29 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MFSD2AQ8NA29 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MFSD2AQ8NA29 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MFSD2AQ8NA29 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MFSD2AQ8NA29 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MFSD2AQ8NA29 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MFSD2AQ8NA29 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MFSD2AQ8NA29 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MFSD2AQ8NA29 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MFSD2AQ8NA29 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MFSD2AQ8NA29 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MFSD2AQ8NA29 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MFSD2AQ8NA29 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MFSD2AQ8NA29 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MFSD2AQ8NA29 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms