Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ANKRD53Q8N9V6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ANKRD53Q8N9V6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ANKRD53Q8N9V6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ANKRD53Q8N9V6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ANKRD53Q8N9V6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ANKRD53Q8N9V6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ANKRD53Q8N9V6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ANKRD53Q8N9V6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ANKRD53Q8N9V6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ANKRD53Q8N9V6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ANKRD53Q8N9V6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ANKRD53Q8N9V6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ANKRD53Q8N9V6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ANKRD53Q8N9V6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ANKRD53Q8N9V6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ANKRD53Q8N9V6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ANKRD53Q8N9V6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ANKRD53Q8N9V6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ANKRD53Q8N9V6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ANKRD53Q8N9V6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ANKRD53Q8N9V6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ANKRD53Q8N9V6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ANKRD53Q8N9V6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ANKRD53Q8N9V6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ANKRD53Q8N9V6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ANKRD53Q8N9V6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ANKRD53Q8N9V6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ANKRD53Q8N9V6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ANKRD53Q8N9V6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ANKRD53Q8N9V6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ANKRD53Q8N9V6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ANKRD53Q8N9V6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ANKRD53Q8N9V6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ANKRD53Q8N9V6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ANKRD53Q8N9V6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ANKRD53Q8N9V6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ANKRD53Q8N9V6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ANKRD53Q8N9V6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ANKRD53Q8N9V6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ANKRD53Q8N9V6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ANKRD53Q8N9V6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ANKRD53Q8N9V6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ANKRD53Q8N9V6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ANKRD53Q8N9V6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ANKRD53Q8N9V6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ANKRD53Q8N9V6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ANKRD53Q8N9V6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ANKRD53Q8N9V6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ANKRD53Q8N9V6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ANKRD53Q8N9V6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ANKRD53Q8N9V6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ANKRD53Q8N9V6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ANKRD53Q8N9V6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ANKRD53Q8N9V6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ANKRD53Q8N9V6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ANKRD53Q8N9V6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ANKRD53Q8N9V6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ANKRD53Q8N9V6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ANKRD53Q8N9V6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ANKRD53Q8N9V6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ANKRD53Q8N9V6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ANKRD53Q8N9V6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ANKRD53Q8N9V6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ANKRD53Q8N9V6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ANKRD53Q8N9V6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD53Q8N9V6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD53Q8N9V6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD53Q8N9V6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD53Q8N9V6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD53Q8N9V6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD53Q8N9V6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD53Q8N9V6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD53Q8N9V6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD53Q8N9V6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD53Q8N9V6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD53Q8N9V6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD53Q8N9V6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD53Q8N9V6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD53Q8N9V6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ANKRD53Q8N9V6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ANKRD53Q8N9V6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ANKRD53Q8N9V6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ANKRD53Q8N9V6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ANKRD53Q8N9V6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ANKRD53Q8N9V6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ANKRD53Q8N9V6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ANKRD53Q8N9V6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ANKRD53Q8N9V6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ANKRD53Q8N9V6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ANKRD53Q8N9V6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ANKRD53Q8N9V6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ANKRD53Q8N9V6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ANKRD53Q8N9V6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ANKRD53Q8N9V6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ANKRD53Q8N9V6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ANKRD53Q8N9V6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ANKRD53Q8N9V6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ANKRD53Q8N9V6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ANKRD53Q8N9V6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms