Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7F7

UBL4B, Ubiquitin-like protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4BQ8N7F7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
UBL4BQ8N7F7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBL4BQ8N7F7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBL4BQ8N7F7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBL4BQ8N7F7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBL4BQ8N7F7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBL4BQ8N7F7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBL4BQ8N7F7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBL4BQ8N7F7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBL4BQ8N7F7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBL4BQ8N7F7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBL4BQ8N7F7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBL4BQ8N7F7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBL4BQ8N7F7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBL4BQ8N7F7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBL4BQ8N7F7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBL4BQ8N7F7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
UBL4BQ8N7F7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBL4BQ8N7F7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBL4BQ8N7F7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBL4BQ8N7F7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBL4BQ8N7F7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBL4BQ8N7F7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBL4BQ8N7F7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBL4BQ8N7F7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBL4BQ8N7F7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBL4BQ8N7F7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBL4BQ8N7F7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBL4BQ8N7F7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBL4BQ8N7F7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBL4BQ8N7F7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBL4BQ8N7F7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBL4BQ8N7F7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBL4BQ8N7F7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBL4BQ8N7F7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBL4BQ8N7F7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBL4BQ8N7F7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBL4BQ8N7F7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBL4BQ8N7F7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBL4BQ8N7F7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBL4BQ8N7F7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
UBL4BQ8N7F7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
UBL4BQ8N7F7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBL4BQ8N7F7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBL4BQ8N7F7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBL4BQ8N7F7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBL4BQ8N7F7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBL4BQ8N7F7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBL4BQ8N7F7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBL4BQ8N7F7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBL4BQ8N7F7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBL4BQ8N7F7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBL4BQ8N7F7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBL4BQ8N7F7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBL4BQ8N7F7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBL4BQ8N7F7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBL4BQ8N7F7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBL4BQ8N7F7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBL4BQ8N7F7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBL4BQ8N7F7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBL4BQ8N7F7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBL4BQ8N7F7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBL4BQ8N7F7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBL4BQ8N7F7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBL4BQ8N7F7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBL4BQ8N7F7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBL4BQ8N7F7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBL4BQ8N7F7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBL4BQ8N7F7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBL4BQ8N7F7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBL4BQ8N7F7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBL4BQ8N7F7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBL4BQ8N7F7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBL4BQ8N7F7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBL4BQ8N7F7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBL4BQ8N7F7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBL4BQ8N7F7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBL4BQ8N7F7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBL4BQ8N7F7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBL4BQ8N7F7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBL4BQ8N7F7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBL4BQ8N7F7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBL4BQ8N7F7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBL4BQ8N7F7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBL4BQ8N7F7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBL4BQ8N7F7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBL4BQ8N7F7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBL4BQ8N7F7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBL4BQ8N7F7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBL4BQ8N7F7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBL4BQ8N7F7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBL4BQ8N7F7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBL4BQ8N7F7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBL4BQ8N7F7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBL4BQ8N7F7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBL4BQ8N7F7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBL4BQ8N7F7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBL4BQ8N7F7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBL4BQ8N7F7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBL4BQ8N7F7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms