Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN19Q8N6F1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN19Q8N6F1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN19Q8N6F1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN19Q8N6F1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN19Q8N6F1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN19Q8N6F1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN19Q8N6F1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN19Q8N6F1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN19Q8N6F1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN19Q8N6F1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN19Q8N6F1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN19Q8N6F1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN19Q8N6F1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN19Q8N6F1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN19Q8N6F1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN19Q8N6F1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN19Q8N6F1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN19Q8N6F1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN19Q8N6F1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN19Q8N6F1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN19Q8N6F1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLDN19Q8N6F1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CLDN19Q8N6F1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLDN19Q8N6F1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLDN19Q8N6F1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLDN19Q8N6F1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLDN19Q8N6F1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLDN19Q8N6F1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLDN19Q8N6F1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLDN19Q8N6F1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLDN19Q8N6F1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN19Q8N6F1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN19Q8N6F1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN19Q8N6F1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN19Q8N6F1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN19Q8N6F1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN19Q8N6F1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN19Q8N6F1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN19Q8N6F1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN19Q8N6F1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN19Q8N6F1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN19Q8N6F1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN19Q8N6F1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN19Q8N6F1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN19Q8N6F1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN19Q8N6F1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN19Q8N6F1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN19Q8N6F1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN19Q8N6F1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN19Q8N6F1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CLDN19Q8N6F1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLDN19Q8N6F1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLDN19Q8N6F1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLDN19Q8N6F1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN19Q8N6F1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN19Q8N6F1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN19Q8N6F1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN19Q8N6F1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN19Q8N6F1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN19Q8N6F1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN19Q8N6F1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN19Q8N6F1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN19Q8N6F1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN19Q8N6F1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN19Q8N6F1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN19Q8N6F1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN19Q8N6F1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN19Q8N6F1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN19Q8N6F1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN19Q8N6F1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN19Q8N6F1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN19Q8N6F1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN19Q8N6F1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDN19Q8N6F1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDN19Q8N6F1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDN19Q8N6F1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDN19Q8N6F1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLDN19Q8N6F1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLDN19Q8N6F1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLDN19Q8N6F1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLDN19Q8N6F1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLDN19Q8N6F1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CLDN19Q8N6F1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLDN19Q8N6F1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN19Q8N6F1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN19Q8N6F1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN19Q8N6F1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN19Q8N6F1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN19Q8N6F1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN19Q8N6F1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN19Q8N6F1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN19Q8N6F1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN19Q8N6F1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN19Q8N6F1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN19Q8N6F1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN19Q8N6F1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN19Q8N6F1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN19Q8N6F1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN19Q8N6F1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
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