Protein–RNA interactions for Protein: Q8N535

LINC00471, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00471, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00471Q8N535 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00471Q8N535 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00471Q8N535 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00471Q8N535 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00471Q8N535 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00471Q8N535 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00471Q8N535 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00471Q8N535 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00471Q8N535 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00471Q8N535 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00471Q8N535 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00471Q8N535 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LINC00471Q8N535 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00471Q8N535 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00471Q8N535 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00471Q8N535 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00471Q8N535 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00471Q8N535 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00471Q8N535 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00471Q8N535 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00471Q8N535 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00471Q8N535 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00471Q8N535 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00471Q8N535 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00471Q8N535 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00471Q8N535 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00471Q8N535 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00471Q8N535 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00471Q8N535 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00471Q8N535 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00471Q8N535 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00471Q8N535 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00471Q8N535 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00471Q8N535 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00471Q8N535 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00471Q8N535 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00471Q8N535 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00471Q8N535 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00471Q8N535 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00471Q8N535 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00471Q8N535 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00471Q8N535 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00471Q8N535 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00471Q8N535 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00471Q8N535 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00471Q8N535 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00471Q8N535 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00471Q8N535 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00471Q8N535 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00471Q8N535 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00471Q8N535 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00471Q8N535 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LINC00471Q8N535 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00471Q8N535 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00471Q8N535 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00471Q8N535 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00471Q8N535 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00471Q8N535 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00471Q8N535 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00471Q8N535 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00471Q8N535 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00471Q8N535 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00471Q8N535 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00471Q8N535 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00471Q8N535 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00471Q8N535 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00471Q8N535 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00471Q8N535 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00471Q8N535 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00471Q8N535 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00471Q8N535 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00471Q8N535 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00471Q8N535 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00471Q8N535 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00471Q8N535 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00471Q8N535 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00471Q8N535 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00471Q8N535 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00471Q8N535 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00471Q8N535 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00471Q8N535 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00471Q8N535 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00471Q8N535 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00471Q8N535 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00471Q8N535 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00471Q8N535 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00471Q8N535 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00471Q8N535 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00471Q8N535 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00471Q8N535 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00471Q8N535 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00471Q8N535 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LINC00471Q8N535 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LINC00471Q8N535 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
LINC00471Q8N535 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LINC00471Q8N535 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00471Q8N535 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00471Q8N535 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00471Q8N535 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00471Q8N535 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms