Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDCL2Q8N4E4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDCL2Q8N4E4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDCL2Q8N4E4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDCL2Q8N4E4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDCL2Q8N4E4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDCL2Q8N4E4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PDCL2Q8N4E4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDCL2Q8N4E4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDCL2Q8N4E4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDCL2Q8N4E4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDCL2Q8N4E4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDCL2Q8N4E4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PDCL2Q8N4E4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDCL2Q8N4E4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDCL2Q8N4E4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDCL2Q8N4E4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDCL2Q8N4E4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDCL2Q8N4E4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDCL2Q8N4E4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PDCL2Q8N4E4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDCL2Q8N4E4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDCL2Q8N4E4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDCL2Q8N4E4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDCL2Q8N4E4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDCL2Q8N4E4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDCL2Q8N4E4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDCL2Q8N4E4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDCL2Q8N4E4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDCL2Q8N4E4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDCL2Q8N4E4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDCL2Q8N4E4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDCL2Q8N4E4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDCL2Q8N4E4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDCL2Q8N4E4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDCL2Q8N4E4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDCL2Q8N4E4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDCL2Q8N4E4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDCL2Q8N4E4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDCL2Q8N4E4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDCL2Q8N4E4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDCL2Q8N4E4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDCL2Q8N4E4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDCL2Q8N4E4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDCL2Q8N4E4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDCL2Q8N4E4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDCL2Q8N4E4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDCL2Q8N4E4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDCL2Q8N4E4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDCL2Q8N4E4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDCL2Q8N4E4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDCL2Q8N4E4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDCL2Q8N4E4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDCL2Q8N4E4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDCL2Q8N4E4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDCL2Q8N4E4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDCL2Q8N4E4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDCL2Q8N4E4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDCL2Q8N4E4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PDCL2Q8N4E4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PDCL2Q8N4E4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDCL2Q8N4E4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDCL2Q8N4E4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDCL2Q8N4E4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDCL2Q8N4E4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDCL2Q8N4E4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDCL2Q8N4E4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDCL2Q8N4E4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDCL2Q8N4E4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDCL2Q8N4E4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDCL2Q8N4E4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PDCL2Q8N4E4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDCL2Q8N4E4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDCL2Q8N4E4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDCL2Q8N4E4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDCL2Q8N4E4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDCL2Q8N4E4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDCL2Q8N4E4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDCL2Q8N4E4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDCL2Q8N4E4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDCL2Q8N4E4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDCL2Q8N4E4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDCL2Q8N4E4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDCL2Q8N4E4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDCL2Q8N4E4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDCL2Q8N4E4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDCL2Q8N4E4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDCL2Q8N4E4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDCL2Q8N4E4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDCL2Q8N4E4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDCL2Q8N4E4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDCL2Q8N4E4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDCL2Q8N4E4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDCL2Q8N4E4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDCL2Q8N4E4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDCL2Q8N4E4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDCL2Q8N4E4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDCL2Q8N4E4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDCL2Q8N4E4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDCL2Q8N4E4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms