Protein–RNA interactions for Protein: Q8N456

LRRC18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC18Q8N456 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRC18Q8N456 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRC18Q8N456 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC18Q8N456 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC18Q8N456 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC18Q8N456 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC18Q8N456 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC18Q8N456 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC18Q8N456 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC18Q8N456 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC18Q8N456 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC18Q8N456 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC18Q8N456 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC18Q8N456 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC18Q8N456 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC18Q8N456 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC18Q8N456 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC18Q8N456 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC18Q8N456 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC18Q8N456 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC18Q8N456 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC18Q8N456 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC18Q8N456 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC18Q8N456 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC18Q8N456 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC18Q8N456 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC18Q8N456 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC18Q8N456 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC18Q8N456 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC18Q8N456 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC18Q8N456 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC18Q8N456 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC18Q8N456 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC18Q8N456 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC18Q8N456 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC18Q8N456 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC18Q8N456 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC18Q8N456 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC18Q8N456 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC18Q8N456 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC18Q8N456 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC18Q8N456 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC18Q8N456 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC18Q8N456 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC18Q8N456 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC18Q8N456 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC18Q8N456 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC18Q8N456 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC18Q8N456 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC18Q8N456 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC18Q8N456 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC18Q8N456 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC18Q8N456 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC18Q8N456 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC18Q8N456 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC18Q8N456 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC18Q8N456 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC18Q8N456 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC18Q8N456 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC18Q8N456 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC18Q8N456 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC18Q8N456 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC18Q8N456 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC18Q8N456 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC18Q8N456 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC18Q8N456 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC18Q8N456 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC18Q8N456 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC18Q8N456 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC18Q8N456 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC18Q8N456 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC18Q8N456 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC18Q8N456 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC18Q8N456 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC18Q8N456 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
LRRC18Q8N456 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
LRRC18Q8N456 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC18Q8N456 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC18Q8N456 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC18Q8N456 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC18Q8N456 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC18Q8N456 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC18Q8N456 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC18Q8N456 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC18Q8N456 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC18Q8N456 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC18Q8N456 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC18Q8N456 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC18Q8N456 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC18Q8N456 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC18Q8N456 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC18Q8N456 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC18Q8N456 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC18Q8N456 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC18Q8N456 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC18Q8N456 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC18Q8N456 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC18Q8N456 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC18Q8N456 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC18Q8N456 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms