Protein–RNA interactions for Protein: Q8N431

RASGEF1C, Ras-GEF domain-containing family member 1C, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1CQ8N431 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RASGEF1CQ8N431 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RASGEF1CQ8N431 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RASGEF1CQ8N431 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RASGEF1CQ8N431 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RASGEF1CQ8N431 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RASGEF1CQ8N431 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RASGEF1CQ8N431 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RASGEF1CQ8N431 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RASGEF1CQ8N431 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RASGEF1CQ8N431 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RASGEF1CQ8N431 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RASGEF1CQ8N431 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RASGEF1CQ8N431 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RASGEF1CQ8N431 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RASGEF1CQ8N431 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RASGEF1CQ8N431 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RASGEF1CQ8N431 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RASGEF1CQ8N431 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RASGEF1CQ8N431 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RASGEF1CQ8N431 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RASGEF1CQ8N431 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RASGEF1CQ8N431 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RASGEF1CQ8N431 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RASGEF1CQ8N431 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RASGEF1CQ8N431 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RASGEF1CQ8N431 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RASGEF1CQ8N431 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RASGEF1CQ8N431 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RASGEF1CQ8N431 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RASGEF1CQ8N431 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RASGEF1CQ8N431 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RASGEF1CQ8N431 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RASGEF1CQ8N431 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RASGEF1CQ8N431 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RASGEF1CQ8N431 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RASGEF1CQ8N431 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RASGEF1CQ8N431 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RASGEF1CQ8N431 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RASGEF1CQ8N431 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RASGEF1CQ8N431 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RASGEF1CQ8N431 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RASGEF1CQ8N431 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RASGEF1CQ8N431 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RASGEF1CQ8N431 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RASGEF1CQ8N431 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RASGEF1CQ8N431 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RASGEF1CQ8N431 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RASGEF1CQ8N431 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RASGEF1CQ8N431 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RASGEF1CQ8N431 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RASGEF1CQ8N431 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RASGEF1CQ8N431 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RASGEF1CQ8N431 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RASGEF1CQ8N431 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RASGEF1CQ8N431 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RASGEF1CQ8N431 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RASGEF1CQ8N431 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RASGEF1CQ8N431 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RASGEF1CQ8N431 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RASGEF1CQ8N431 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RASGEF1CQ8N431 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RASGEF1CQ8N431 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RASGEF1CQ8N431 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RASGEF1CQ8N431 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RASGEF1CQ8N431 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RASGEF1CQ8N431 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RASGEF1CQ8N431 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RASGEF1CQ8N431 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RASGEF1CQ8N431 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RASGEF1CQ8N431 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RASGEF1CQ8N431 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RASGEF1CQ8N431 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RASGEF1CQ8N431 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RASGEF1CQ8N431 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RASGEF1CQ8N431 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RASGEF1CQ8N431 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RASGEF1CQ8N431 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RASGEF1CQ8N431 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RASGEF1CQ8N431 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RASGEF1CQ8N431 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RASGEF1CQ8N431 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RASGEF1CQ8N431 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RASGEF1CQ8N431 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RASGEF1CQ8N431 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RASGEF1CQ8N431 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RASGEF1CQ8N431 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RASGEF1CQ8N431 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RASGEF1CQ8N431 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RASGEF1CQ8N431 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RASGEF1CQ8N431 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RASGEF1CQ8N431 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RASGEF1CQ8N431 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RASGEF1CQ8N431 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RASGEF1CQ8N431 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RASGEF1CQ8N431 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RASGEF1CQ8N431 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RASGEF1CQ8N431 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RASGEF1CQ8N431 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RASGEF1CQ8N431 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 845.6 ms