Protein–RNA interactions for Protein: Q8N377

Putative uncharacterized protein LOC387726, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8N377 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N377 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N377 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N377 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N377 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N377 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8N377 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8N377 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8N377 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8N377 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8N377 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8N377 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N377 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N377 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N377 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N377 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8N377 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N377 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N377 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N377 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N377 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8N377 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8N377 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8N377 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8N377 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8N377 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8N377 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8N377 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8N377 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8N377 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8N377 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8N377 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8N377 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8N377 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8N377 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8N377 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8N377 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8N377 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8N377 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8N377 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8N377 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8N377 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8N377 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8N377 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8N377 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8N377 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8N377 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8N377 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8N377 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8N377 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8N377 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8N377 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8N377 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8N377 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8N377 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8N377 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8N377 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8N377 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8N377 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8N377 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8N377 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8N377 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8N377 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8N377 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8N377 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8N377 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8N377 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8N377 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8N377 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8N377 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8N377 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8N377 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8N377 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8N377 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8N377 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8N377 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8N377 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8N377 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N377 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N377 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N377 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q8N377 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N377 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N377 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N377 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N377 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N377 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N377 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N377 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N377 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N377 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N377 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N377 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N377 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N377 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N377 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N377 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8N377 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8N377 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8N377 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms